Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbbp8Q80YR6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbbp8Q80YR6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbbp8Q80YR6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbbp8Q80YR6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbbp8Q80YR6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbbp8Q80YR6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbbp8Q80YR6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbbp8Q80YR6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbbp8Q80YR6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbbp8Q80YR6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbbp8Q80YR6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp8Q80YR6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp8Q80YR6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp8Q80YR6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp8Q80YR6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbbp8Q80YR6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbbp8Q80YR6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbbp8Q80YR6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbbp8Q80YR6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbbp8Q80YR6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbbp8Q80YR6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp8Q80YR6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp8Q80YR6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp8Q80YR6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbbp8Q80YR6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbbp8Q80YR6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbbp8Q80YR6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbbp8Q80YR6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp8Q80YR6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp8Q80YR6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbbp8Q80YR6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbbp8Q80YR6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbbp8Q80YR6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbbp8Q80YR6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbbp8Q80YR6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbbp8Q80YR6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbbp8Q80YR6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbbp8Q80YR6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbbp8Q80YR6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbbp8Q80YR6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbbp8Q80YR6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp8Q80YR6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp8Q80YR6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp8Q80YR6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp8Q80YR6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp8Q80YR6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbbp8Q80YR6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbbp8Q80YR6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbbp8Q80YR6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbbp8Q80YR6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbbp8Q80YR6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbbp8Q80YR6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp8Q80YR6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbbp8Q80YR6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbbp8Q80YR6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbbp8Q80YR6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp8Q80YR6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp8Q80YR6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp8Q80YR6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp8Q80YR6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbbp8Q80YR6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbbp8Q80YR6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbbp8Q80YR6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbbp8Q80YR6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbbp8Q80YR6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbbp8Q80YR6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp8Q80YR6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp8Q80YR6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbbp8Q80YR6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbbp8Q80YR6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbbp8Q80YR6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rbbp8Q80YR6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbbp8Q80YR6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbbp8Q80YR6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbbp8Q80YR6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbbp8Q80YR6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp8Q80YR6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp8Q80YR6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp8Q80YR6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp8Q80YR6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp8Q80YR6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp8Q80YR6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbbp8Q80YR6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbbp8Q80YR6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbbp8Q80YR6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbbp8Q80YR6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp8Q80YR6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp8Q80YR6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp8Q80YR6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp8Q80YR6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp8Q80YR6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbbp8Q80YR6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbbp8Q80YR6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms