Protein–RNA interactions for Protein: Q80W99

Catsper3, Cation channel sperm-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper3Q80W99 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Catsper3Q80W99 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Catsper3Q80W99 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Catsper3Q80W99 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Catsper3Q80W99 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Catsper3Q80W99 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Catsper3Q80W99 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Catsper3Q80W99 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Catsper3Q80W99 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Catsper3Q80W99 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Catsper3Q80W99 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Catsper3Q80W99 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Catsper3Q80W99 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Catsper3Q80W99 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Catsper3Q80W99 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Catsper3Q80W99 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Catsper3Q80W99 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Catsper3Q80W99 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Catsper3Q80W99 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Catsper3Q80W99 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Catsper3Q80W99 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Catsper3Q80W99 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Catsper3Q80W99 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Catsper3Q80W99 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Catsper3Q80W99 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Catsper3Q80W99 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Catsper3Q80W99 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Catsper3Q80W99 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Catsper3Q80W99 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Catsper3Q80W99 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Catsper3Q80W99 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Catsper3Q80W99 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Catsper3Q80W99 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Catsper3Q80W99 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Catsper3Q80W99 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Catsper3Q80W99 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Catsper3Q80W99 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Catsper3Q80W99 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Catsper3Q80W99 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Catsper3Q80W99 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Catsper3Q80W99 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Catsper3Q80W99 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Catsper3Q80W99 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Catsper3Q80W99 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Catsper3Q80W99 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Catsper3Q80W99 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Catsper3Q80W99 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Catsper3Q80W99 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Catsper3Q80W99 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Catsper3Q80W99 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Catsper3Q80W99 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Catsper3Q80W99 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Catsper3Q80W99 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Catsper3Q80W99 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Catsper3Q80W99 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Catsper3Q80W99 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Catsper3Q80W99 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Catsper3Q80W99 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Catsper3Q80W99 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Catsper3Q80W99 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Catsper3Q80W99 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Catsper3Q80W99 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Catsper3Q80W99 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Catsper3Q80W99 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Catsper3Q80W99 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Catsper3Q80W99 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Catsper3Q80W99 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Catsper3Q80W99 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Catsper3Q80W99 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Catsper3Q80W99 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Catsper3Q80W99 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Catsper3Q80W99 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Catsper3Q80W99 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Catsper3Q80W99 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Catsper3Q80W99 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Catsper3Q80W99 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Catsper3Q80W99 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Catsper3Q80W99 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Catsper3Q80W99 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Catsper3Q80W99 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Catsper3Q80W99 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Catsper3Q80W99 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Catsper3Q80W99 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Catsper3Q80W99 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Catsper3Q80W99 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Catsper3Q80W99 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Catsper3Q80W99 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Catsper3Q80W99 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Catsper3Q80W99 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Catsper3Q80W99 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Catsper3Q80W99 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Catsper3Q80W99 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Catsper3Q80W99 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Catsper3Q80W99 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Catsper3Q80W99 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Catsper3Q80W99 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Catsper3Q80W99 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Catsper3Q80W99 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Catsper3Q80W99 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Catsper3Q80W99 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms