Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
AknaQ80VW7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
AknaQ80VW7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
AknaQ80VW7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC39.42■■■■□ 3.9
AknaQ80VW7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
AknaQ80VW7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
AknaQ80VW7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
AknaQ80VW7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
AknaQ80VW7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
AknaQ80VW7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
AknaQ80VW7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
AknaQ80VW7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
AknaQ80VW7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
AknaQ80VW7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
AknaQ80VW7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
AknaQ80VW7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
AknaQ80VW7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
AknaQ80VW7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
AknaQ80VW7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
AknaQ80VW7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
AknaQ80VW7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
AknaQ80VW7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
AknaQ80VW7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
AknaQ80VW7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
AknaQ80VW7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
AknaQ80VW7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
AknaQ80VW7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
AknaQ80VW7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
AknaQ80VW7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
AknaQ80VW7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
AknaQ80VW7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
AknaQ80VW7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
AknaQ80VW7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
AknaQ80VW7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
AknaQ80VW7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC39.2■■■■□ 3.87
AknaQ80VW7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
AknaQ80VW7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
AknaQ80VW7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
AknaQ80VW7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
AknaQ80VW7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
AknaQ80VW7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
AknaQ80VW7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
AknaQ80VW7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
AknaQ80VW7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
AknaQ80VW7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
AknaQ80VW7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
AknaQ80VW7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
AknaQ80VW7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC39.08■■■■□ 3.85
AknaQ80VW7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
AknaQ80VW7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
AknaQ80VW7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
AknaQ80VW7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
AknaQ80VW7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
AknaQ80VW7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
AknaQ80VW7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
AknaQ80VW7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
AknaQ80VW7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
AknaQ80VW7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
AknaQ80VW7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
AknaQ80VW7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
AknaQ80VW7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
AknaQ80VW7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
AknaQ80VW7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
AknaQ80VW7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
AknaQ80VW7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
AknaQ80VW7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
AknaQ80VW7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
AknaQ80VW7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
AknaQ80VW7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
AknaQ80VW7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
AknaQ80VW7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
AknaQ80VW7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
AknaQ80VW7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC38.93■■■■□ 3.82
AknaQ80VW7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
AknaQ80VW7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
AknaQ80VW7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
AknaQ80VW7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
AknaQ80VW7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
AknaQ80VW7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
AknaQ80VW7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
AknaQ80VW7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
AknaQ80VW7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
AknaQ80VW7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
AknaQ80VW7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
AknaQ80VW7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
AknaQ80VW7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
AknaQ80VW7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
AknaQ80VW7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
AknaQ80VW7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
AknaQ80VW7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
AknaQ80VW7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
AknaQ80VW7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
AknaQ80VW7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
AknaQ80VW7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
AknaQ80VW7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
AknaQ80VW7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
AknaQ80VW7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
AknaQ80VW7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
AknaQ80VW7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
AknaQ80VW7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms