Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aldh3b1Q80VQ0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aldh3b1Q80VQ0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Aldh3b1Q80VQ0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh3b1Q80VQ0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh3b1Q80VQ0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aldh3b1Q80VQ0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aldh3b1Q80VQ0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aldh3b1Q80VQ0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aldh3b1Q80VQ0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aldh3b1Q80VQ0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh3b1Q80VQ0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh3b1Q80VQ0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh3b1Q80VQ0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh3b1Q80VQ0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh3b1Q80VQ0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh3b1Q80VQ0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aldh3b1Q80VQ0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aldh3b1Q80VQ0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aldh3b1Q80VQ0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aldh3b1Q80VQ0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh3b1Q80VQ0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh3b1Q80VQ0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh3b1Q80VQ0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh3b1Q80VQ0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh3b1Q80VQ0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh3b1Q80VQ0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh3b1Q80VQ0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh3b1Q80VQ0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh3b1Q80VQ0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh3b1Q80VQ0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aldh3b1Q80VQ0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aldh3b1Q80VQ0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aldh3b1Q80VQ0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Aldh3b1Q80VQ0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aldh3b1Q80VQ0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aldh3b1Q80VQ0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh3b1Q80VQ0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh3b1Q80VQ0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aldh3b1Q80VQ0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aldh3b1Q80VQ0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aldh3b1Q80VQ0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aldh3b1Q80VQ0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh3b1Q80VQ0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh3b1Q80VQ0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh3b1Q80VQ0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh3b1Q80VQ0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh3b1Q80VQ0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh3b1Q80VQ0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh3b1Q80VQ0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh3b1Q80VQ0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh3b1Q80VQ0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh3b1Q80VQ0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh3b1Q80VQ0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh3b1Q80VQ0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh3b1Q80VQ0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aldh3b1Q80VQ0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aldh3b1Q80VQ0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Aldh3b1Q80VQ0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh3b1Q80VQ0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh3b1Q80VQ0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh3b1Q80VQ0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh3b1Q80VQ0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh3b1Q80VQ0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh3b1Q80VQ0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh3b1Q80VQ0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh3b1Q80VQ0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh3b1Q80VQ0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh3b1Q80VQ0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh3b1Q80VQ0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh3b1Q80VQ0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh3b1Q80VQ0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh3b1Q80VQ0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh3b1Q80VQ0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms