Protein–RNA interactions for Protein: Q80TR8

Dcaf1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf1Q80TR8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
Dcaf1Q80TR8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC47.54■■■■■ 5.2
Dcaf1Q80TR8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
Dcaf1Q80TR8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC47.52■■■■■ 5.2
Dcaf1Q80TR8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
Dcaf1Q80TR8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.19
Dcaf1Q80TR8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
Dcaf1Q80TR8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC47.42■■■■■ 5.18
Dcaf1Q80TR8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.41■■■■■ 5.18
Dcaf1Q80TR8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC47.4■■■■■ 5.18
Dcaf1Q80TR8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.38■■■■■ 5.18
Dcaf1Q80TR8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
Dcaf1Q80TR8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
Dcaf1Q80TR8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
Dcaf1Q80TR8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC47.37■■■■■ 5.17
Dcaf1Q80TR8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
Dcaf1Q80TR8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC47.36■■■■■ 5.17
Dcaf1Q80TR8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
Dcaf1Q80TR8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
Dcaf1Q80TR8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
Dcaf1Q80TR8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
Dcaf1Q80TR8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
Dcaf1Q80TR8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
Dcaf1Q80TR8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
Dcaf1Q80TR8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
Dcaf1Q80TR8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
Dcaf1Q80TR8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
Dcaf1Q80TR8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
Dcaf1Q80TR8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
Dcaf1Q80TR8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
Dcaf1Q80TR8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC47.22■■■■■ 5.15
Dcaf1Q80TR8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
Dcaf1Q80TR8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC47.16■■■■■ 5.14
Dcaf1Q80TR8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
Dcaf1Q80TR8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.13
Dcaf1Q80TR8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC47.12■■■■■ 5.13
Dcaf1Q80TR8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
Dcaf1Q80TR8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
Dcaf1Q80TR8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC47.09■■■■■ 5.13
Dcaf1Q80TR8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC47.07■■■■■ 5.13
Dcaf1Q80TR8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
Dcaf1Q80TR8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
Dcaf1Q80TR8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC47.02■■■■■ 5.12
Dcaf1Q80TR8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC47.02■■■■■ 5.12
Dcaf1Q80TR8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
Dcaf1Q80TR8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
Dcaf1Q80TR8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
Dcaf1Q80TR8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.98■■■■■ 5.11
Dcaf1Q80TR8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.97■■■■■ 5.11
Dcaf1Q80TR8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
Dcaf1Q80TR8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
Dcaf1Q80TR8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
Dcaf1Q80TR8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
Dcaf1Q80TR8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC46.95■■■■■ 5.11
Dcaf1Q80TR8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
Dcaf1Q80TR8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
Dcaf1Q80TR8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC46.92■■■■■ 5.1
Dcaf1Q80TR8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
Dcaf1Q80TR8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.89■■■■■ 5.1
Dcaf1Q80TR8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC46.87■■■■■ 5.09
Dcaf1Q80TR8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC46.86■■■■■ 5.09
Dcaf1Q80TR8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
Dcaf1Q80TR8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
Dcaf1Q80TR8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
Dcaf1Q80TR8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC46.79■■■■■ 5.08
Dcaf1Q80TR8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
Dcaf1Q80TR8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC46.78■■■■■ 5.08
Dcaf1Q80TR8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC46.78■■■■■ 5.08
Dcaf1Q80TR8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
Dcaf1Q80TR8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
Dcaf1Q80TR8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
Dcaf1Q80TR8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
Dcaf1Q80TR8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
Dcaf1Q80TR8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
Dcaf1Q80TR8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
Dcaf1Q80TR8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
Dcaf1Q80TR8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
Dcaf1Q80TR8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
Dcaf1Q80TR8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
Dcaf1Q80TR8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.07
Dcaf1Q80TR8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC46.68■■■■■ 5.06
Dcaf1Q80TR8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC46.68■■■■■ 5.06
Dcaf1Q80TR8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.68■■■■■ 5.06
Dcaf1Q80TR8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
Dcaf1Q80TR8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC46.67■■■■■ 5.06
Dcaf1Q80TR8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
Dcaf1Q80TR8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC46.65■■■■■ 5.06
Dcaf1Q80TR8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
Dcaf1Q80TR8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
Dcaf1Q80TR8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
Dcaf1Q80TR8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.61■■■■■ 5.05
Dcaf1Q80TR8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
Dcaf1Q80TR8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC46.59■■■■■ 5.05
Dcaf1Q80TR8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC46.59■■■■■ 5.05
Dcaf1Q80TR8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
Dcaf1Q80TR8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
Dcaf1Q80TR8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
Dcaf1Q80TR8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
Dcaf1Q80TR8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
Dcaf1Q80TR8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.2 ms