Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC53.36■■■■■ 6.13
NischQ80TM9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.35■■■■■ 6.13
NischQ80TM9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC53.35■■■■■ 6.13
NischQ80TM9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC53.35■■■■■ 6.13
NischQ80TM9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.32■■■■■ 6.13
NischQ80TM9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC53.32■■■■■ 6.13
NischQ80TM9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC53.28■■■■■ 6.12
NischQ80TM9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC53.27■■■■■ 6.12
NischQ80TM9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC53.26■■■■■ 6.12
NischQ80TM9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC53.26■■■■■ 6.12
NischQ80TM9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.25■■■■■ 6.12
NischQ80TM9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.25■■■■■ 6.12
NischQ80TM9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC53.24■■■■■ 6.11
NischQ80TM9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC53.24■■■■■ 6.11
NischQ80TM9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC53.22■■■■■ 6.11
NischQ80TM9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC53.21■■■■■ 6.11
NischQ80TM9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC53.2■■■■■ 6.11
NischQ80TM9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.2■■■■■ 6.11
NischQ80TM9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.19■■■■■ 6.1
NischQ80TM9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC53.16■■■■■ 6.1
NischQ80TM9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.14■■■■■ 6.1
NischQ80TM9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC53.14■■■■■ 6.1
NischQ80TM9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.11■■■■■ 6.09
NischQ80TM9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.09■■■■■ 6.09
NischQ80TM9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.08■■■■■ 6.09
NischQ80TM9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.05■■■■■ 6.08
NischQ80TM9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC53.05■■■■■ 6.08
NischQ80TM9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.04■■■■■ 6.08
NischQ80TM9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC53.03■■■■■ 6.08
NischQ80TM9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.03■■■■■ 6.08
NischQ80TM9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.03■■■■■ 6.08
NischQ80TM9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC53.03■■■■■ 6.08
NischQ80TM9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC52.99■■■■■ 6.07
NischQ80TM9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC52.98■■■■■ 6.07
NischQ80TM9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.98■■■■■ 6.07
NischQ80TM9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.92■■■■■ 6.06
NischQ80TM9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC52.91■■■■■ 6.06
NischQ80TM9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC52.91■■■■■ 6.06
NischQ80TM9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.89■■■■■ 6.06
NischQ80TM9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.89■■■■■ 6.06
NischQ80TM9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.89■■■■■ 6.06
NischQ80TM9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.88■■■■■ 6.06
NischQ80TM9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC52.88■■■■■ 6.06
NischQ80TM9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC52.83■■■■■ 6.05
NischQ80TM9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.83■■■■■ 6.05
NischQ80TM9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC52.81■■■■■ 6.05
NischQ80TM9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC52.81■■■■■ 6.04
NischQ80TM9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC52.81■■■■■ 6.04
NischQ80TM9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC52.79■■■■■ 6.04
NischQ80TM9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC52.78■■■■■ 6.04
NischQ80TM9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.76■■■■■ 6.04
NischQ80TM9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.72■■■■■ 6.03
NischQ80TM9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.72■■■■■ 6.03
NischQ80TM9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.71■■■■■ 6.03
NischQ80TM9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.71■■■■■ 6.03
NischQ80TM9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC52.68■■■■■ 6.02
NischQ80TM9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.68■■■■■ 6.02
NischQ80TM9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.68■■■■■ 6.02
NischQ80TM9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC52.67■■■■■ 6.02
NischQ80TM9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC52.67■■■■■ 6.02
NischQ80TM9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.66■■■■■ 6.02
NischQ80TM9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.66■■■■■ 6.02
NischQ80TM9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.66■■■■■ 6.02
NischQ80TM9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC52.65■■■■■ 6.02
NischQ80TM9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC52.64■■■■■ 6.02
NischQ80TM9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC52.63■■■■■ 6.02
NischQ80TM9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC52.61■■■■■ 6.01
NischQ80TM9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.61■■■■■ 6.01
NischQ80TM9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.61■■■■■ 6.01
NischQ80TM9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.58■■■■■ 6.01
NischQ80TM9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.58■■■■■ 6.01
NischQ80TM9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC52.56■■■■■ 6
NischQ80TM9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.55■■■■■ 6
NischQ80TM9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC52.55■■■■■ 6
NischQ80TM9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC52.53■■■■■ 6
NischQ80TM9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC52.53■■■■■ 6
NischQ80TM9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.53■■■■■ 6
NischQ80TM9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.52■■■■■ 6
NischQ80TM9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC52.5■■■■■ 5.99
NischQ80TM9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC52.49■■■■■ 5.99
NischQ80TM9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.49■■■■■ 5.99
NischQ80TM9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.49■■■■■ 5.99
NischQ80TM9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.47■■■■■ 5.99
NischQ80TM9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC52.46■■■■■ 5.99
NischQ80TM9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC52.44■■■■■ 5.99
NischQ80TM9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC52.43■■■■■ 5.98
NischQ80TM9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC52.42■■■■■ 5.98
NischQ80TM9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.42■■■■■ 5.98
NischQ80TM9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.42■■■■■ 5.98
NischQ80TM9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.41■■■■■ 5.98
NischQ80TM9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.4■■■■■ 5.98
NischQ80TM9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.4■■■■■ 5.98
NischQ80TM9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC52.39■■■■■ 5.98
NischQ80TM9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC52.39■■■■■ 5.98
NischQ80TM9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC52.38■■■■■ 5.98
NischQ80TM9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.38■■■■■ 5.98
NischQ80TM9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.38■■■■■ 5.98
NischQ80TM9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.37■■■■■ 5.97
NischQ80TM9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.37■■■■■ 5.97
NischQ80TM9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC52.35■■■■■ 5.97
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