Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamp3Q7TST5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamp3Q7TST5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamp3Q7TST5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamp3Q7TST5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamp3Q7TST5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamp3Q7TST5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamp3Q7TST5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamp3Q7TST5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamp3Q7TST5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamp3Q7TST5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamp3Q7TST5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamp3Q7TST5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamp3Q7TST5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamp3Q7TST5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamp3Q7TST5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamp3Q7TST5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamp3Q7TST5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamp3Q7TST5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamp3Q7TST5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamp3Q7TST5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamp3Q7TST5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamp3Q7TST5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamp3Q7TST5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamp3Q7TST5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamp3Q7TST5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamp3Q7TST5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamp3Q7TST5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamp3Q7TST5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamp3Q7TST5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamp3Q7TST5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamp3Q7TST5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamp3Q7TST5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamp3Q7TST5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamp3Q7TST5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamp3Q7TST5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamp3Q7TST5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamp3Q7TST5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamp3Q7TST5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamp3Q7TST5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamp3Q7TST5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamp3Q7TST5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamp3Q7TST5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamp3Q7TST5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamp3Q7TST5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamp3Q7TST5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamp3Q7TST5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamp3Q7TST5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamp3Q7TST5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamp3Q7TST5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamp3Q7TST5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamp3Q7TST5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lamp3Q7TST5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lamp3Q7TST5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lamp3Q7TST5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lamp3Q7TST5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lamp3Q7TST5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lamp3Q7TST5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lamp3Q7TST5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lamp3Q7TST5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lamp3Q7TST5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamp3Q7TST5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamp3Q7TST5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamp3Q7TST5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamp3Q7TST5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lamp3Q7TST5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lamp3Q7TST5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamp3Q7TST5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lamp3Q7TST5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lamp3Q7TST5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lamp3Q7TST5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lamp3Q7TST5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lamp3Q7TST5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamp3Q7TST5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamp3Q7TST5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamp3Q7TST5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms