Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PhkbQ7TSH2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PhkbQ7TSH2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PhkbQ7TSH2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PhkbQ7TSH2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PhkbQ7TSH2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PhkbQ7TSH2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PhkbQ7TSH2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PhkbQ7TSH2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PhkbQ7TSH2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PhkbQ7TSH2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PhkbQ7TSH2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PhkbQ7TSH2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PhkbQ7TSH2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
PhkbQ7TSH2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PhkbQ7TSH2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PhkbQ7TSH2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PhkbQ7TSH2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PhkbQ7TSH2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PhkbQ7TSH2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PhkbQ7TSH2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PhkbQ7TSH2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PhkbQ7TSH2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PhkbQ7TSH2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PhkbQ7TSH2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PhkbQ7TSH2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PhkbQ7TSH2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PhkbQ7TSH2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PhkbQ7TSH2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PhkbQ7TSH2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PhkbQ7TSH2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PhkbQ7TSH2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PhkbQ7TSH2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PhkbQ7TSH2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PhkbQ7TSH2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PhkbQ7TSH2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PhkbQ7TSH2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PhkbQ7TSH2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PhkbQ7TSH2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PhkbQ7TSH2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PhkbQ7TSH2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PhkbQ7TSH2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PhkbQ7TSH2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PhkbQ7TSH2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PhkbQ7TSH2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PhkbQ7TSH2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PhkbQ7TSH2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PhkbQ7TSH2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PhkbQ7TSH2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PhkbQ7TSH2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PhkbQ7TSH2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PhkbQ7TSH2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PhkbQ7TSH2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PhkbQ7TSH2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PhkbQ7TSH2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PhkbQ7TSH2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PhkbQ7TSH2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PhkbQ7TSH2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PhkbQ7TSH2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PhkbQ7TSH2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PhkbQ7TSH2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PhkbQ7TSH2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PhkbQ7TSH2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PhkbQ7TSH2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PhkbQ7TSH2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PhkbQ7TSH2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PhkbQ7TSH2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PhkbQ7TSH2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PhkbQ7TSH2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PhkbQ7TSH2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PhkbQ7TSH2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PhkbQ7TSH2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PhkbQ7TSH2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PhkbQ7TSH2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PhkbQ7TSH2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PhkbQ7TSH2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PhkbQ7TSH2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PhkbQ7TSH2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PhkbQ7TSH2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PhkbQ7TSH2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PhkbQ7TSH2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PhkbQ7TSH2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PhkbQ7TSH2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PhkbQ7TSH2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PhkbQ7TSH2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PhkbQ7TSH2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PhkbQ7TSH2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PhkbQ7TSH2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PhkbQ7TSH2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PhkbQ7TSH2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PhkbQ7TSH2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PhkbQ7TSH2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PhkbQ7TSH2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PhkbQ7TSH2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PhkbQ7TSH2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PhkbQ7TSH2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PhkbQ7TSH2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PhkbQ7TSH2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PhkbQ7TSH2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PhkbQ7TSH2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms