Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPS0

Rps6ka6, Ribosomal protein S6 kinase alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka6Q7TPS0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rps6ka6Q7TPS0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps6ka6Q7TPS0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps6ka6Q7TPS0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps6ka6Q7TPS0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps6ka6Q7TPS0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps6ka6Q7TPS0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps6ka6Q7TPS0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps6ka6Q7TPS0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps6ka6Q7TPS0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps6ka6Q7TPS0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps6ka6Q7TPS0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps6ka6Q7TPS0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps6ka6Q7TPS0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps6ka6Q7TPS0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps6ka6Q7TPS0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps6ka6Q7TPS0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps6ka6Q7TPS0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps6ka6Q7TPS0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps6ka6Q7TPS0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps6ka6Q7TPS0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps6ka6Q7TPS0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps6ka6Q7TPS0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps6ka6Q7TPS0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps6ka6Q7TPS0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6ka6Q7TPS0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6ka6Q7TPS0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rps6ka6Q7TPS0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rps6ka6Q7TPS0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps6ka6Q7TPS0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps6ka6Q7TPS0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps6ka6Q7TPS0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rps6ka6Q7TPS0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rps6ka6Q7TPS0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps6ka6Q7TPS0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps6ka6Q7TPS0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps6ka6Q7TPS0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps6ka6Q7TPS0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rps6ka6Q7TPS0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rps6ka6Q7TPS0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rps6ka6Q7TPS0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rps6ka6Q7TPS0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rps6ka6Q7TPS0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rps6ka6Q7TPS0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rps6ka6Q7TPS0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rps6ka6Q7TPS0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rps6ka6Q7TPS0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rps6ka6Q7TPS0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rps6ka6Q7TPS0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rps6ka6Q7TPS0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rps6ka6Q7TPS0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6ka6Q7TPS0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6ka6Q7TPS0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rps6ka6Q7TPS0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rps6ka6Q7TPS0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rps6ka6Q7TPS0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rps6ka6Q7TPS0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rps6ka6Q7TPS0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rps6ka6Q7TPS0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rps6ka6Q7TPS0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rps6ka6Q7TPS0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rps6ka6Q7TPS0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rps6ka6Q7TPS0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rps6ka6Q7TPS0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rps6ka6Q7TPS0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rps6ka6Q7TPS0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rps6ka6Q7TPS0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rps6ka6Q7TPS0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rps6ka6Q7TPS0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rps6ka6Q7TPS0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rps6ka6Q7TPS0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rps6ka6Q7TPS0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rps6ka6Q7TPS0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rps6ka6Q7TPS0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rps6ka6Q7TPS0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rps6ka6Q7TPS0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rps6ka6Q7TPS0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rps6ka6Q7TPS0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rps6ka6Q7TPS0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rps6ka6Q7TPS0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rps6ka6Q7TPS0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rps6ka6Q7TPS0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rps6ka6Q7TPS0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rps6ka6Q7TPS0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rps6ka6Q7TPS0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rps6ka6Q7TPS0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rps6ka6Q7TPS0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rps6ka6Q7TPS0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rps6ka6Q7TPS0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rps6ka6Q7TPS0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rps6ka6Q7TPS0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rps6ka6Q7TPS0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rps6ka6Q7TPS0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rps6ka6Q7TPS0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rps6ka6Q7TPS0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rps6ka6Q7TPS0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rps6ka6Q7TPS0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rps6ka6Q7TPS0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rps6ka6Q7TPS0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rps6ka6Q7TPS0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms