Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNM2

Trim46, Tripartite motif-containing protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim46Q7TNM2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim46Q7TNM2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim46Q7TNM2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim46Q7TNM2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim46Q7TNM2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim46Q7TNM2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim46Q7TNM2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim46Q7TNM2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim46Q7TNM2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim46Q7TNM2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim46Q7TNM2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim46Q7TNM2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim46Q7TNM2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim46Q7TNM2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim46Q7TNM2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim46Q7TNM2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim46Q7TNM2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim46Q7TNM2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim46Q7TNM2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim46Q7TNM2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim46Q7TNM2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim46Q7TNM2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim46Q7TNM2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim46Q7TNM2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim46Q7TNM2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim46Q7TNM2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim46Q7TNM2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim46Q7TNM2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim46Q7TNM2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim46Q7TNM2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim46Q7TNM2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim46Q7TNM2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim46Q7TNM2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim46Q7TNM2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim46Q7TNM2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim46Q7TNM2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim46Q7TNM2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim46Q7TNM2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim46Q7TNM2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim46Q7TNM2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim46Q7TNM2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim46Q7TNM2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim46Q7TNM2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim46Q7TNM2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim46Q7TNM2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim46Q7TNM2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim46Q7TNM2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim46Q7TNM2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim46Q7TNM2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim46Q7TNM2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim46Q7TNM2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim46Q7TNM2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim46Q7TNM2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim46Q7TNM2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim46Q7TNM2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim46Q7TNM2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim46Q7TNM2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim46Q7TNM2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim46Q7TNM2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim46Q7TNM2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim46Q7TNM2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim46Q7TNM2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim46Q7TNM2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim46Q7TNM2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim46Q7TNM2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim46Q7TNM2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim46Q7TNM2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim46Q7TNM2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim46Q7TNM2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim46Q7TNM2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim46Q7TNM2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim46Q7TNM2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim46Q7TNM2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim46Q7TNM2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim46Q7TNM2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim46Q7TNM2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim46Q7TNM2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim46Q7TNM2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim46Q7TNM2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim46Q7TNM2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim46Q7TNM2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim46Q7TNM2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim46Q7TNM2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim46Q7TNM2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim46Q7TNM2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim46Q7TNM2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim46Q7TNM2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim46Q7TNM2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim46Q7TNM2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim46Q7TNM2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim46Q7TNM2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim46Q7TNM2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim46Q7TNM2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim46Q7TNM2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim46Q7TNM2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim46Q7TNM2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim46Q7TNM2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim46Q7TNM2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim46Q7TNM2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim46Q7TNM2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms