Protein–RNA interactions for Protein: Q78PG9

Ccdc25, Coiled-coil domain-containing protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc25Q78PG9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc25Q78PG9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc25Q78PG9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc25Q78PG9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc25Q78PG9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc25Q78PG9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc25Q78PG9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc25Q78PG9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc25Q78PG9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc25Q78PG9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc25Q78PG9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc25Q78PG9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc25Q78PG9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc25Q78PG9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc25Q78PG9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc25Q78PG9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc25Q78PG9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc25Q78PG9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc25Q78PG9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc25Q78PG9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc25Q78PG9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc25Q78PG9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc25Q78PG9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc25Q78PG9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc25Q78PG9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc25Q78PG9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc25Q78PG9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc25Q78PG9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc25Q78PG9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc25Q78PG9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc25Q78PG9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc25Q78PG9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc25Q78PG9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc25Q78PG9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc25Q78PG9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc25Q78PG9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc25Q78PG9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc25Q78PG9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc25Q78PG9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc25Q78PG9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc25Q78PG9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc25Q78PG9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc25Q78PG9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc25Q78PG9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc25Q78PG9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc25Q78PG9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc25Q78PG9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc25Q78PG9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc25Q78PG9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc25Q78PG9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc25Q78PG9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc25Q78PG9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc25Q78PG9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc25Q78PG9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc25Q78PG9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc25Q78PG9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc25Q78PG9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc25Q78PG9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc25Q78PG9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc25Q78PG9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc25Q78PG9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc25Q78PG9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc25Q78PG9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc25Q78PG9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc25Q78PG9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc25Q78PG9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc25Q78PG9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc25Q78PG9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc25Q78PG9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc25Q78PG9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc25Q78PG9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc25Q78PG9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc25Q78PG9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc25Q78PG9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc25Q78PG9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc25Q78PG9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc25Q78PG9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc25Q78PG9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc25Q78PG9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc25Q78PG9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc25Q78PG9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc25Q78PG9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc25Q78PG9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc25Q78PG9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc25Q78PG9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc25Q78PG9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc25Q78PG9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc25Q78PG9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc25Q78PG9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc25Q78PG9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc25Q78PG9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc25Q78PG9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc25Q78PG9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc25Q78PG9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc25Q78PG9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc25Q78PG9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc25Q78PG9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc25Q78PG9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc25Q78PG9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc25Q78PG9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms