Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed3Q78IS1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed3Q78IS1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed3Q78IS1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed3Q78IS1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed3Q78IS1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed3Q78IS1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed3Q78IS1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed3Q78IS1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed3Q78IS1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed3Q78IS1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed3Q78IS1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed3Q78IS1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed3Q78IS1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed3Q78IS1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed3Q78IS1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed3Q78IS1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed3Q78IS1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed3Q78IS1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed3Q78IS1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmed3Q78IS1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed3Q78IS1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed3Q78IS1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed3Q78IS1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed3Q78IS1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed3Q78IS1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed3Q78IS1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed3Q78IS1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed3Q78IS1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed3Q78IS1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed3Q78IS1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed3Q78IS1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed3Q78IS1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed3Q78IS1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmed3Q78IS1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmed3Q78IS1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmed3Q78IS1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmed3Q78IS1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmed3Q78IS1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmed3Q78IS1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmed3Q78IS1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmed3Q78IS1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed3Q78IS1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed3Q78IS1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed3Q78IS1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed3Q78IS1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed3Q78IS1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmed3Q78IS1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed3Q78IS1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed3Q78IS1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed3Q78IS1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed3Q78IS1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed3Q78IS1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed3Q78IS1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed3Q78IS1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed3Q78IS1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmed3Q78IS1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed3Q78IS1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed3Q78IS1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed3Q78IS1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed3Q78IS1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed3Q78IS1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed3Q78IS1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed3Q78IS1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed3Q78IS1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed3Q78IS1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed3Q78IS1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed3Q78IS1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed3Q78IS1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed3Q78IS1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed3Q78IS1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed3Q78IS1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed3Q78IS1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed3Q78IS1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed3Q78IS1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed3Q78IS1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed3Q78IS1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed3Q78IS1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed3Q78IS1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed3Q78IS1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed3Q78IS1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed3Q78IS1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed3Q78IS1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed3Q78IS1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed3Q78IS1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed3Q78IS1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed3Q78IS1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed3Q78IS1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed3Q78IS1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed3Q78IS1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed3Q78IS1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed3Q78IS1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed3Q78IS1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed3Q78IS1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed3Q78IS1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed3Q78IS1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed3Q78IS1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed3Q78IS1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed3Q78IS1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed3Q78IS1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms