Protein–RNA interactions for Protein: Q76KF0

Sema6d, Semaphorin-6D, mousemouse

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6dQ76KF0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sema6dQ76KF0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema6dQ76KF0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema6dQ76KF0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema6dQ76KF0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema6dQ76KF0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema6dQ76KF0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema6dQ76KF0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema6dQ76KF0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema6dQ76KF0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema6dQ76KF0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema6dQ76KF0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema6dQ76KF0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema6dQ76KF0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema6dQ76KF0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema6dQ76KF0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema6dQ76KF0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema6dQ76KF0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sema6dQ76KF0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sema6dQ76KF0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sema6dQ76KF0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema6dQ76KF0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema6dQ76KF0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema6dQ76KF0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema6dQ76KF0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sema6dQ76KF0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sema6dQ76KF0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sema6dQ76KF0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sema6dQ76KF0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sema6dQ76KF0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sema6dQ76KF0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sema6dQ76KF0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sema6dQ76KF0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sema6dQ76KF0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sema6dQ76KF0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sema6dQ76KF0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sema6dQ76KF0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sema6dQ76KF0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sema6dQ76KF0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sema6dQ76KF0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sema6dQ76KF0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sema6dQ76KF0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sema6dQ76KF0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sema6dQ76KF0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sema6dQ76KF0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sema6dQ76KF0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sema6dQ76KF0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Sema6dQ76KF0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sema6dQ76KF0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sema6dQ76KF0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sema6dQ76KF0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sema6dQ76KF0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sema6dQ76KF0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sema6dQ76KF0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sema6dQ76KF0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sema6dQ76KF0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sema6dQ76KF0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sema6dQ76KF0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sema6dQ76KF0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema6dQ76KF0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema6dQ76KF0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema6dQ76KF0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema6dQ76KF0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema6dQ76KF0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema6dQ76KF0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema6dQ76KF0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema6dQ76KF0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema6dQ76KF0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema6dQ76KF0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema6dQ76KF0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema6dQ76KF0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema6dQ76KF0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema6dQ76KF0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema6dQ76KF0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema6dQ76KF0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema6dQ76KF0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sema6dQ76KF0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sema6dQ76KF0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Sema6dQ76KF0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sema6dQ76KF0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sema6dQ76KF0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6dQ76KF0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6dQ76KF0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6dQ76KF0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6dQ76KF0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6dQ76KF0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6dQ76KF0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6dQ76KF0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6dQ76KF0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6dQ76KF0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6dQ76KF0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6dQ76KF0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6dQ76KF0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6dQ76KF0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6dQ76KF0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sema6dQ76KF0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sema6dQ76KF0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sema6dQ76KF0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sema6dQ76KF0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sema6dQ76KF0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms