Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rph3alQ768S4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rph3alQ768S4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rph3alQ768S4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rph3alQ768S4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rph3alQ768S4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rph3alQ768S4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rph3alQ768S4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rph3alQ768S4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rph3alQ768S4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rph3alQ768S4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rph3alQ768S4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rph3alQ768S4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rph3alQ768S4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rph3alQ768S4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rph3alQ768S4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rph3alQ768S4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rph3alQ768S4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rph3alQ768S4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rph3alQ768S4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rph3alQ768S4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rph3alQ768S4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rph3alQ768S4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rph3alQ768S4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rph3alQ768S4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rph3alQ768S4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rph3alQ768S4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rph3alQ768S4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rph3alQ768S4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rph3alQ768S4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rph3alQ768S4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rph3alQ768S4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rph3alQ768S4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rph3alQ768S4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rph3alQ768S4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rph3alQ768S4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rph3alQ768S4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rph3alQ768S4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rph3alQ768S4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms