Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Sned1Q70E20 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Sned1Q70E20 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Sned1Q70E20 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Sned1Q70E20 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30,96■■■□□ 2,55
Sned1Q70E20 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Sned1Q70E20 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Sned1Q70E20 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC30,94■■■□□ 2,54
Sned1Q70E20 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Sned1Q70E20 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Sned1Q70E20 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Sned1Q70E20 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Sned1Q70E20 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Sned1Q70E20 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Sned1Q70E20 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Sned1Q70E20 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Sned1Q70E20 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC30,9■■■□□ 2,54
Sned1Q70E20 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30,89■■■□□ 2,53
Sned1Q70E20 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC30,89■■■□□ 2,53
Sned1Q70E20 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,53
Sned1Q70E20 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC30,88■■■□□ 2,53
Sned1Q70E20 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30,88■■■□□ 2,53
Sned1Q70E20 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Sned1Q70E20 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Sned1Q70E20 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30,88■■■□□ 2,53
Sned1Q70E20 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30,85■■■□□ 2,53
Sned1Q70E20 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Sned1Q70E20 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC30,84■■■□□ 2,53
Sned1Q70E20 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Sned1Q70E20 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC30,82■■■□□ 2,52
Sned1Q70E20 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Sned1Q70E20 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Sned1Q70E20 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,81■■■□□ 2,52
Sned1Q70E20 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30,8■■■□□ 2,52
Sned1Q70E20 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Sned1Q70E20 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,78■■■□□ 2,52
Sned1Q70E20 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Sned1Q70E20 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Sned1Q70E20 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,52
Sned1Q70E20 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Sned1Q70E20 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Sned1Q70E20 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Sned1Q70E20 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Sned1Q70E20 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Sned1Q70E20 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Sned1Q70E20 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Sned1Q70E20 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Sned1Q70E20 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Sned1Q70E20 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Sned1Q70E20 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC30,7■■■□□ 2,5
Sned1Q70E20 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC30,7■■■□□ 2,5
Sned1Q70E20 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Sned1Q70E20 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Sned1Q70E20 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Sned1Q70E20 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Sned1Q70E20 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Sned1Q70E20 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Sned1Q70E20 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC30,64■■■□□ 2,49
Sned1Q70E20 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Sned1Q70E20 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Sned1Q70E20 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Sned1Q70E20 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Sned1Q70E20 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Sned1Q70E20 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Sned1Q70E20 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC30,59■■■□□ 2,49
Sned1Q70E20 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Sned1Q70E20 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Sned1Q70E20 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Sned1Q70E20 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Sned1Q70E20 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Sned1Q70E20 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Sned1Q70E20 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Sned1Q70E20 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Sned1Q70E20 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Sned1Q70E20 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Sned1Q70E20 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Sned1Q70E20 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Sned1Q70E20 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Sned1Q70E20 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Sned1Q70E20 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Sned1Q70E20 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Sned1Q70E20 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Sned1Q70E20 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Sned1Q70E20 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30,5■■■□□ 2,47
Sned1Q70E20 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Sned1Q70E20 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Sned1Q70E20 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Sned1Q70E20 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Sned1Q70E20 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Sned1Q70E20 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC30,47■■■□□ 2,47
Sned1Q70E20 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC30,47■■■□□ 2,47
Sned1Q70E20 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Sned1Q70E20 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC30,47■■■□□ 2,47
Sned1Q70E20 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC30,47■■■□□ 2,47
Sned1Q70E20 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Sned1Q70E20 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Sned1Q70E20 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Sned1Q70E20 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Sned1Q70E20 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30,46■■■□□ 2,47
Sned1Q70E20 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,6 ms