Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syne2Q6ZWQ0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syne2Q6ZWQ0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syne2Q6ZWQ0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Syne2Q6ZWQ0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syne2Q6ZWQ0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syne2Q6ZWQ0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syne2Q6ZWQ0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syne2Q6ZWQ0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syne2Q6ZWQ0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syne2Q6ZWQ0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Syne2Q6ZWQ0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Syne2Q6ZWQ0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syne2Q6ZWQ0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syne2Q6ZWQ0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syne2Q6ZWQ0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syne2Q6ZWQ0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syne2Q6ZWQ0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syne2Q6ZWQ0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syne2Q6ZWQ0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syne2Q6ZWQ0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syne2Q6ZWQ0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syne2Q6ZWQ0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Syne2Q6ZWQ0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Syne2Q6ZWQ0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms