Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nup188Q6ZQH8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nup188Q6ZQH8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nup188Q6ZQH8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nup188Q6ZQH8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nup188Q6ZQH8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nup188Q6ZQH8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nup188Q6ZQH8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nup188Q6ZQH8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nup188Q6ZQH8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nup188Q6ZQH8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nup188Q6ZQH8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nup188Q6ZQH8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nup188Q6ZQH8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nup188Q6ZQH8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nup188Q6ZQH8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nup188Q6ZQH8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nup188Q6ZQH8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nup188Q6ZQH8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nup188Q6ZQH8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nup188Q6ZQH8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nup188Q6ZQH8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nup188Q6ZQH8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nup188Q6ZQH8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nup188Q6ZQH8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Nup188Q6ZQH8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nup188Q6ZQH8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nup188Q6ZQH8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nup188Q6ZQH8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nup188Q6ZQH8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nup188Q6ZQH8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nup188Q6ZQH8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nup188Q6ZQH8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nup188Q6ZQH8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nup188Q6ZQH8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nup188Q6ZQH8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Nup188Q6ZQH8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nup188Q6ZQH8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nup188Q6ZQH8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nup188Q6ZQH8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nup188Q6ZQH8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nup188Q6ZQH8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nup188Q6ZQH8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nup188Q6ZQH8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nup188Q6ZQH8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nup188Q6ZQH8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nup188Q6ZQH8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nup188Q6ZQH8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nup188Q6ZQH8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nup188Q6ZQH8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nup188Q6ZQH8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nup188Q6ZQH8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nup188Q6ZQH8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nup188Q6ZQH8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nup188Q6ZQH8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nup188Q6ZQH8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nup188Q6ZQH8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nup188Q6ZQH8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Nup188Q6ZQH8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nup188Q6ZQH8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nup188Q6ZQH8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Nup188Q6ZQH8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nup188Q6ZQH8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nup188Q6ZQH8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nup188Q6ZQH8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nup188Q6ZQH8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nup188Q6ZQH8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nup188Q6ZQH8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nup188Q6ZQH8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nup188Q6ZQH8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nup188Q6ZQH8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nup188Q6ZQH8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Nup188Q6ZQH8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nup188Q6ZQH8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nup188Q6ZQH8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nup188Q6ZQH8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nup188Q6ZQH8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nup188Q6ZQH8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nup188Q6ZQH8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nup188Q6ZQH8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nup188Q6ZQH8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nup188Q6ZQH8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Nup188Q6ZQH8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nup188Q6ZQH8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nup188Q6ZQH8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nup188Q6ZQH8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nup188Q6ZQH8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Nup188Q6ZQH8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nup188Q6ZQH8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Nup188Q6ZQH8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nup188Q6ZQH8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nup188Q6ZQH8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nup188Q6ZQH8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nup188Q6ZQH8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nup188Q6ZQH8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nup188Q6ZQH8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nup188Q6ZQH8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nup188Q6ZQH8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nup188Q6ZQH8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nup188Q6ZQH8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms