Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Glis3Q6XP49 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Glis3Q6XP49 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Glis3Q6XP49 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Glis3Q6XP49 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Glis3Q6XP49 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Glis3Q6XP49 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Glis3Q6XP49 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Glis3Q6XP49 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Glis3Q6XP49 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Glis3Q6XP49 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Glis3Q6XP49 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Glis3Q6XP49 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Glis3Q6XP49 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Glis3Q6XP49 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Glis3Q6XP49 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Glis3Q6XP49 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Glis3Q6XP49 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Glis3Q6XP49 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Glis3Q6XP49 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Glis3Q6XP49 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Glis3Q6XP49 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Glis3Q6XP49 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Glis3Q6XP49 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Glis3Q6XP49 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Glis3Q6XP49 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Glis3Q6XP49 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Glis3Q6XP49 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Glis3Q6XP49 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Glis3Q6XP49 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Glis3Q6XP49 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Glis3Q6XP49 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Glis3Q6XP49 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Glis3Q6XP49 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Glis3Q6XP49 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Glis3Q6XP49 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Glis3Q6XP49 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Glis3Q6XP49 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Glis3Q6XP49 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Glis3Q6XP49 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Glis3Q6XP49 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Glis3Q6XP49 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Glis3Q6XP49 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Glis3Q6XP49 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Glis3Q6XP49 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Glis3Q6XP49 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Glis3Q6XP49 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Glis3Q6XP49 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Glis3Q6XP49 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Glis3Q6XP49 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Glis3Q6XP49 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Glis3Q6XP49 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Glis3Q6XP49 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Glis3Q6XP49 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Glis3Q6XP49 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Glis3Q6XP49 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Glis3Q6XP49 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Glis3Q6XP49 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Glis3Q6XP49 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Glis3Q6XP49 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Glis3Q6XP49 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Glis3Q6XP49 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Glis3Q6XP49 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Glis3Q6XP49 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Glis3Q6XP49 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Glis3Q6XP49 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Glis3Q6XP49 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Glis3Q6XP49 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Glis3Q6XP49 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Glis3Q6XP49 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Glis3Q6XP49 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Glis3Q6XP49 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Glis3Q6XP49 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Glis3Q6XP49 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Glis3Q6XP49 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Glis3Q6XP49 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Glis3Q6XP49 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Glis3Q6XP49 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Glis3Q6XP49 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Glis3Q6XP49 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Glis3Q6XP49 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Glis3Q6XP49 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Glis3Q6XP49 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Glis3Q6XP49 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Glis3Q6XP49 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Glis3Q6XP49 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Glis3Q6XP49 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Glis3Q6XP49 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Glis3Q6XP49 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Glis3Q6XP49 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Glis3Q6XP49 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Glis3Q6XP49 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Glis3Q6XP49 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Glis3Q6XP49 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Glis3Q6XP49 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Glis3Q6XP49 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Glis3Q6XP49 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Glis3Q6XP49 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Glis3Q6XP49 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Glis3Q6XP49 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms