Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Casc1Q6TDU8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Casc1Q6TDU8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Casc1Q6TDU8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Casc1Q6TDU8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Casc1Q6TDU8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Casc1Q6TDU8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Casc1Q6TDU8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Casc1Q6TDU8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Casc1Q6TDU8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Casc1Q6TDU8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Casc1Q6TDU8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Casc1Q6TDU8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Casc1Q6TDU8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Casc1Q6TDU8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Casc1Q6TDU8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Casc1Q6TDU8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Casc1Q6TDU8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Casc1Q6TDU8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Casc1Q6TDU8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Casc1Q6TDU8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Casc1Q6TDU8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Casc1Q6TDU8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Casc1Q6TDU8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Casc1Q6TDU8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Casc1Q6TDU8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Casc1Q6TDU8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Casc1Q6TDU8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Casc1Q6TDU8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Casc1Q6TDU8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Casc1Q6TDU8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Casc1Q6TDU8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Casc1Q6TDU8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Casc1Q6TDU8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Casc1Q6TDU8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Casc1Q6TDU8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Casc1Q6TDU8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Casc1Q6TDU8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Casc1Q6TDU8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Casc1Q6TDU8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Casc1Q6TDU8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Casc1Q6TDU8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Casc1Q6TDU8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Casc1Q6TDU8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Casc1Q6TDU8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Casc1Q6TDU8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Casc1Q6TDU8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Casc1Q6TDU8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Casc1Q6TDU8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Casc1Q6TDU8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Casc1Q6TDU8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Casc1Q6TDU8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Casc1Q6TDU8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Casc1Q6TDU8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Casc1Q6TDU8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Casc1Q6TDU8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Casc1Q6TDU8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Casc1Q6TDU8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Casc1Q6TDU8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Casc1Q6TDU8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Casc1Q6TDU8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Casc1Q6TDU8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Casc1Q6TDU8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Casc1Q6TDU8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Casc1Q6TDU8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Casc1Q6TDU8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Casc1Q6TDU8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Casc1Q6TDU8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Casc1Q6TDU8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Casc1Q6TDU8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Casc1Q6TDU8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Casc1Q6TDU8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Casc1Q6TDU8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Casc1Q6TDU8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Casc1Q6TDU8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Casc1Q6TDU8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Casc1Q6TDU8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Casc1Q6TDU8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Casc1Q6TDU8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Casc1Q6TDU8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Casc1Q6TDU8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Casc1Q6TDU8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Casc1Q6TDU8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Casc1Q6TDU8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Casc1Q6TDU8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Casc1Q6TDU8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Casc1Q6TDU8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Casc1Q6TDU8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Casc1Q6TDU8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Casc1Q6TDU8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Casc1Q6TDU8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Casc1Q6TDU8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Casc1Q6TDU8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Casc1Q6TDU8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Casc1Q6TDU8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Casc1Q6TDU8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Casc1Q6TDU8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Casc1Q6TDU8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Casc1Q6TDU8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Casc1Q6TDU8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms