Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R3

Crip3, Cysteine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip3Q6Q6R3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crip3Q6Q6R3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crip3Q6Q6R3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crip3Q6Q6R3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crip3Q6Q6R3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crip3Q6Q6R3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crip3Q6Q6R3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crip3Q6Q6R3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crip3Q6Q6R3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Crip3Q6Q6R3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crip3Q6Q6R3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crip3Q6Q6R3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crip3Q6Q6R3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crip3Q6Q6R3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crip3Q6Q6R3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crip3Q6Q6R3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crip3Q6Q6R3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crip3Q6Q6R3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crip3Q6Q6R3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Crip3Q6Q6R3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Crip3Q6Q6R3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Crip3Q6Q6R3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Crip3Q6Q6R3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Crip3Q6Q6R3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Crip3Q6Q6R3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Crip3Q6Q6R3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Crip3Q6Q6R3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Crip3Q6Q6R3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Crip3Q6Q6R3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Crip3Q6Q6R3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Crip3Q6Q6R3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Crip3Q6Q6R3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Crip3Q6Q6R3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Crip3Q6Q6R3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Crip3Q6Q6R3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Crip3Q6Q6R3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Crip3Q6Q6R3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Crip3Q6Q6R3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Crip3Q6Q6R3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Crip3Q6Q6R3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Crip3Q6Q6R3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Crip3Q6Q6R3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Crip3Q6Q6R3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Crip3Q6Q6R3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Crip3Q6Q6R3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Crip3Q6Q6R3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Crip3Q6Q6R3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Crip3Q6Q6R3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Crip3Q6Q6R3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Crip3Q6Q6R3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Crip3Q6Q6R3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Crip3Q6Q6R3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Crip3Q6Q6R3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Crip3Q6Q6R3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Crip3Q6Q6R3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Crip3Q6Q6R3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Crip3Q6Q6R3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Crip3Q6Q6R3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Crip3Q6Q6R3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Crip3Q6Q6R3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Crip3Q6Q6R3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Crip3Q6Q6R3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Crip3Q6Q6R3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Crip3Q6Q6R3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Crip3Q6Q6R3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Crip3Q6Q6R3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Crip3Q6Q6R3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Crip3Q6Q6R3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Crip3Q6Q6R3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Crip3Q6Q6R3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Crip3Q6Q6R3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Crip3Q6Q6R3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Crip3Q6Q6R3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Crip3Q6Q6R3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Crip3Q6Q6R3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Crip3Q6Q6R3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Crip3Q6Q6R3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Crip3Q6Q6R3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Crip3Q6Q6R3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Crip3Q6Q6R3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crip3Q6Q6R3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crip3Q6Q6R3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Crip3Q6Q6R3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crip3Q6Q6R3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Crip3Q6Q6R3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crip3Q6Q6R3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crip3Q6Q6R3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crip3Q6Q6R3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Crip3Q6Q6R3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crip3Q6Q6R3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crip3Q6Q6R3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crip3Q6Q6R3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crip3Q6Q6R3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crip3Q6Q6R3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crip3Q6Q6R3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crip3Q6Q6R3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crip3Q6Q6R3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crip3Q6Q6R3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crip3Q6Q6R3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crip3Q6Q6R3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms