Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnip4Q6PHZ8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnip4Q6PHZ8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnip4Q6PHZ8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnip4Q6PHZ8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnip4Q6PHZ8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnip4Q6PHZ8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kcnip4Q6PHZ8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kcnip4Q6PHZ8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kcnip4Q6PHZ8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kcnip4Q6PHZ8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kcnip4Q6PHZ8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnip4Q6PHZ8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnip4Q6PHZ8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnip4Q6PHZ8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnip4Q6PHZ8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnip4Q6PHZ8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnip4Q6PHZ8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnip4Q6PHZ8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnip4Q6PHZ8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnip4Q6PHZ8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnip4Q6PHZ8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnip4Q6PHZ8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnip4Q6PHZ8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnip4Q6PHZ8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnip4Q6PHZ8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnip4Q6PHZ8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnip4Q6PHZ8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnip4Q6PHZ8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Kcnip4Q6PHZ8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnip4Q6PHZ8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnip4Q6PHZ8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnip4Q6PHZ8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kcnip4Q6PHZ8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kcnip4Q6PHZ8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kcnip4Q6PHZ8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnip4Q6PHZ8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnip4Q6PHZ8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnip4Q6PHZ8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kcnip4Q6PHZ8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kcnip4Q6PHZ8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kcnip4Q6PHZ8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Kcnip4Q6PHZ8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kcnip4Q6PHZ8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kcnip4Q6PHZ8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnip4Q6PHZ8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnip4Q6PHZ8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kcnip4Q6PHZ8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kcnip4Q6PHZ8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kcnip4Q6PHZ8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kcnip4Q6PHZ8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kcnip4Q6PHZ8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kcnip4Q6PHZ8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnip4Q6PHZ8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnip4Q6PHZ8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnip4Q6PHZ8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnip4Q6PHZ8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnip4Q6PHZ8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnip4Q6PHZ8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnip4Q6PHZ8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnip4Q6PHZ8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnip4Q6PHZ8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnip4Q6PHZ8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kcnip4Q6PHZ8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kcnip4Q6PHZ8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kcnip4Q6PHZ8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kcnip4Q6PHZ8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnip4Q6PHZ8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnip4Q6PHZ8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnip4Q6PHZ8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnip4Q6PHZ8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnip4Q6PHZ8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnip4Q6PHZ8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnip4Q6PHZ8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 564.2 ms