Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HjurpQ6PG16 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HjurpQ6PG16 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HjurpQ6PG16 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HjurpQ6PG16 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HjurpQ6PG16 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HjurpQ6PG16 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HjurpQ6PG16 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HjurpQ6PG16 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HjurpQ6PG16 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HjurpQ6PG16 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HjurpQ6PG16 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HjurpQ6PG16 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HjurpQ6PG16 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HjurpQ6PG16 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HjurpQ6PG16 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HjurpQ6PG16 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HjurpQ6PG16 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HjurpQ6PG16 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HjurpQ6PG16 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HjurpQ6PG16 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HjurpQ6PG16 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HjurpQ6PG16 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HjurpQ6PG16 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HjurpQ6PG16 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HjurpQ6PG16 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HjurpQ6PG16 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HjurpQ6PG16 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HjurpQ6PG16 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HjurpQ6PG16 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HjurpQ6PG16 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HjurpQ6PG16 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HjurpQ6PG16 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HjurpQ6PG16 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HjurpQ6PG16 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HjurpQ6PG16 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HjurpQ6PG16 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HjurpQ6PG16 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HjurpQ6PG16 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HjurpQ6PG16 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HjurpQ6PG16 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HjurpQ6PG16 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HjurpQ6PG16 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HjurpQ6PG16 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HjurpQ6PG16 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HjurpQ6PG16 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HjurpQ6PG16 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HjurpQ6PG16 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HjurpQ6PG16 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HjurpQ6PG16 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HjurpQ6PG16 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HjurpQ6PG16 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HjurpQ6PG16 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HjurpQ6PG16 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HjurpQ6PG16 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HjurpQ6PG16 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HjurpQ6PG16 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HjurpQ6PG16 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HjurpQ6PG16 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HjurpQ6PG16 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HjurpQ6PG16 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HjurpQ6PG16 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HjurpQ6PG16 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HjurpQ6PG16 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HjurpQ6PG16 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HjurpQ6PG16 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HjurpQ6PG16 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HjurpQ6PG16 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HjurpQ6PG16 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HjurpQ6PG16 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HjurpQ6PG16 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HjurpQ6PG16 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HjurpQ6PG16 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HjurpQ6PG16 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HjurpQ6PG16 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HjurpQ6PG16 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HjurpQ6PG16 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HjurpQ6PG16 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HjurpQ6PG16 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HjurpQ6PG16 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HjurpQ6PG16 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HjurpQ6PG16 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HjurpQ6PG16 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HjurpQ6PG16 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HjurpQ6PG16 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HjurpQ6PG16 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HjurpQ6PG16 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HjurpQ6PG16 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HjurpQ6PG16 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HjurpQ6PG16 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HjurpQ6PG16 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HjurpQ6PG16 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HjurpQ6PG16 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HjurpQ6PG16 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HjurpQ6PG16 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HjurpQ6PG16 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HjurpQ6PG16 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HjurpQ6PG16 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HjurpQ6PG16 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HjurpQ6PG16 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms