Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim45Q6PFY8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim45Q6PFY8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim45Q6PFY8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim45Q6PFY8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim45Q6PFY8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim45Q6PFY8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim45Q6PFY8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim45Q6PFY8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim45Q6PFY8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim45Q6PFY8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim45Q6PFY8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim45Q6PFY8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim45Q6PFY8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim45Q6PFY8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim45Q6PFY8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim45Q6PFY8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim45Q6PFY8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim45Q6PFY8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim45Q6PFY8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim45Q6PFY8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim45Q6PFY8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim45Q6PFY8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim45Q6PFY8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim45Q6PFY8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim45Q6PFY8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim45Q6PFY8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim45Q6PFY8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim45Q6PFY8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim45Q6PFY8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim45Q6PFY8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim45Q6PFY8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim45Q6PFY8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim45Q6PFY8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim45Q6PFY8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim45Q6PFY8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim45Q6PFY8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim45Q6PFY8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim45Q6PFY8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim45Q6PFY8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim45Q6PFY8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim45Q6PFY8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim45Q6PFY8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim45Q6PFY8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim45Q6PFY8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim45Q6PFY8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim45Q6PFY8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim45Q6PFY8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim45Q6PFY8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim45Q6PFY8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim45Q6PFY8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim45Q6PFY8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim45Q6PFY8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim45Q6PFY8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim45Q6PFY8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim45Q6PFY8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim45Q6PFY8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim45Q6PFY8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim45Q6PFY8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim45Q6PFY8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim45Q6PFY8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim45Q6PFY8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim45Q6PFY8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim45Q6PFY8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim45Q6PFY8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim45Q6PFY8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim45Q6PFY8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim45Q6PFY8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim45Q6PFY8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim45Q6PFY8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim45Q6PFY8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim45Q6PFY8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim45Q6PFY8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim45Q6PFY8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim45Q6PFY8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim45Q6PFY8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim45Q6PFY8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim45Q6PFY8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim45Q6PFY8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim45Q6PFY8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim45Q6PFY8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim45Q6PFY8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim45Q6PFY8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim45Q6PFY8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim45Q6PFY8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim45Q6PFY8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim45Q6PFY8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim45Q6PFY8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim45Q6PFY8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim45Q6PFY8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim45Q6PFY8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim45Q6PFY8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim45Q6PFY8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim45Q6PFY8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim45Q6PFY8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim45Q6PFY8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim45Q6PFY8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim45Q6PFY8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim45Q6PFY8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim45Q6PFY8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms