Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc85bQ6PDY0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc85bQ6PDY0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc85bQ6PDY0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc85bQ6PDY0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc85bQ6PDY0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc85bQ6PDY0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc85bQ6PDY0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc85bQ6PDY0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc85bQ6PDY0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc85bQ6PDY0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc85bQ6PDY0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc85bQ6PDY0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc85bQ6PDY0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc85bQ6PDY0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc85bQ6PDY0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc85bQ6PDY0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc85bQ6PDY0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc85bQ6PDY0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc85bQ6PDY0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc85bQ6PDY0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc85bQ6PDY0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc85bQ6PDY0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc85bQ6PDY0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc85bQ6PDY0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc85bQ6PDY0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc85bQ6PDY0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc85bQ6PDY0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc85bQ6PDY0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc85bQ6PDY0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc85bQ6PDY0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc85bQ6PDY0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc85bQ6PDY0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc85bQ6PDY0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc85bQ6PDY0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc85bQ6PDY0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc85bQ6PDY0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc85bQ6PDY0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc85bQ6PDY0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc85bQ6PDY0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc85bQ6PDY0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc85bQ6PDY0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc85bQ6PDY0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc85bQ6PDY0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc85bQ6PDY0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc85bQ6PDY0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc85bQ6PDY0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc85bQ6PDY0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc85bQ6PDY0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc85bQ6PDY0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc85bQ6PDY0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc85bQ6PDY0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc85bQ6PDY0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc85bQ6PDY0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc85bQ6PDY0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc85bQ6PDY0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc85bQ6PDY0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc85bQ6PDY0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc85bQ6PDY0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc85bQ6PDY0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc85bQ6PDY0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc85bQ6PDY0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc85bQ6PDY0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc85bQ6PDY0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc85bQ6PDY0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc85bQ6PDY0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc85bQ6PDY0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc85bQ6PDY0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc85bQ6PDY0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc85bQ6PDY0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc85bQ6PDY0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc85bQ6PDY0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc85bQ6PDY0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc85bQ6PDY0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc85bQ6PDY0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc85bQ6PDY0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc85bQ6PDY0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc85bQ6PDY0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc85bQ6PDY0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc85bQ6PDY0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc85bQ6PDY0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc85bQ6PDY0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms