Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dtx4Q6PDK8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dtx4Q6PDK8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dtx4Q6PDK8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dtx4Q6PDK8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dtx4Q6PDK8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dtx4Q6PDK8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dtx4Q6PDK8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dtx4Q6PDK8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dtx4Q6PDK8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dtx4Q6PDK8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dtx4Q6PDK8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dtx4Q6PDK8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dtx4Q6PDK8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dtx4Q6PDK8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dtx4Q6PDK8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dtx4Q6PDK8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dtx4Q6PDK8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dtx4Q6PDK8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dtx4Q6PDK8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dtx4Q6PDK8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Dtx4Q6PDK8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dtx4Q6PDK8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Dtx4Q6PDK8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dtx4Q6PDK8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dtx4Q6PDK8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dtx4Q6PDK8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dtx4Q6PDK8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dtx4Q6PDK8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dtx4Q6PDK8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dtx4Q6PDK8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dtx4Q6PDK8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dtx4Q6PDK8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dtx4Q6PDK8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dtx4Q6PDK8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dtx4Q6PDK8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dtx4Q6PDK8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dtx4Q6PDK8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dtx4Q6PDK8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dtx4Q6PDK8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dtx4Q6PDK8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dtx4Q6PDK8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dtx4Q6PDK8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dtx4Q6PDK8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dtx4Q6PDK8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dtx4Q6PDK8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dtx4Q6PDK8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dtx4Q6PDK8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dtx4Q6PDK8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dtx4Q6PDK8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dtx4Q6PDK8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dtx4Q6PDK8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dtx4Q6PDK8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dtx4Q6PDK8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dtx4Q6PDK8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dtx4Q6PDK8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dtx4Q6PDK8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dtx4Q6PDK8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dtx4Q6PDK8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dtx4Q6PDK8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dtx4Q6PDK8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dtx4Q6PDK8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dtx4Q6PDK8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dtx4Q6PDK8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dtx4Q6PDK8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dtx4Q6PDK8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dtx4Q6PDK8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dtx4Q6PDK8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dtx4Q6PDK8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dtx4Q6PDK8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dtx4Q6PDK8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dtx4Q6PDK8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dtx4Q6PDK8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dtx4Q6PDK8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dtx4Q6PDK8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dtx4Q6PDK8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Dtx4Q6PDK8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dtx4Q6PDK8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dtx4Q6PDK8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dtx4Q6PDK8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dtx4Q6PDK8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dtx4Q6PDK8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dtx4Q6PDK8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dtx4Q6PDK8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dtx4Q6PDK8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dtx4Q6PDK8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Dtx4Q6PDK8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dtx4Q6PDK8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dtx4Q6PDK8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dtx4Q6PDK8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dtx4Q6PDK8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Dtx4Q6PDK8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dtx4Q6PDK8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dtx4Q6PDK8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dtx4Q6PDK8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dtx4Q6PDK8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dtx4Q6PDK8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dtx4Q6PDK8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dtx4Q6PDK8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dtx4Q6PDK8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms