Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SvoplQ6PDF3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SvoplQ6PDF3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SvoplQ6PDF3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SvoplQ6PDF3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SvoplQ6PDF3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SvoplQ6PDF3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SvoplQ6PDF3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SvoplQ6PDF3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SvoplQ6PDF3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SvoplQ6PDF3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SvoplQ6PDF3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SvoplQ6PDF3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SvoplQ6PDF3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SvoplQ6PDF3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SvoplQ6PDF3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SvoplQ6PDF3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SvoplQ6PDF3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SvoplQ6PDF3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SvoplQ6PDF3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SvoplQ6PDF3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SvoplQ6PDF3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SvoplQ6PDF3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SvoplQ6PDF3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SvoplQ6PDF3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SvoplQ6PDF3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SvoplQ6PDF3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SvoplQ6PDF3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SvoplQ6PDF3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SvoplQ6PDF3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SvoplQ6PDF3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SvoplQ6PDF3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SvoplQ6PDF3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SvoplQ6PDF3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SvoplQ6PDF3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SvoplQ6PDF3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SvoplQ6PDF3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SvoplQ6PDF3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SvoplQ6PDF3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SvoplQ6PDF3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SvoplQ6PDF3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SvoplQ6PDF3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SvoplQ6PDF3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SvoplQ6PDF3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SvoplQ6PDF3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SvoplQ6PDF3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SvoplQ6PDF3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SvoplQ6PDF3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SvoplQ6PDF3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SvoplQ6PDF3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SvoplQ6PDF3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SvoplQ6PDF3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SvoplQ6PDF3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SvoplQ6PDF3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SvoplQ6PDF3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SvoplQ6PDF3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SvoplQ6PDF3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SvoplQ6PDF3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SvoplQ6PDF3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SvoplQ6PDF3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SvoplQ6PDF3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SvoplQ6PDF3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SvoplQ6PDF3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SvoplQ6PDF3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SvoplQ6PDF3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SvoplQ6PDF3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SvoplQ6PDF3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SvoplQ6PDF3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SvoplQ6PDF3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SvoplQ6PDF3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SvoplQ6PDF3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SvoplQ6PDF3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SvoplQ6PDF3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SvoplQ6PDF3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SvoplQ6PDF3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SvoplQ6PDF3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SvoplQ6PDF3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SvoplQ6PDF3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SvoplQ6PDF3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SvoplQ6PDF3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SvoplQ6PDF3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SvoplQ6PDF3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SvoplQ6PDF3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194.7 ms