Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ9

Prrg3, Transmembrane gamma-carboxyglutamic acid protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrg3Q6PAQ9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prrg3Q6PAQ9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prrg3Q6PAQ9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prrg3Q6PAQ9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prrg3Q6PAQ9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Prrg3Q6PAQ9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prrg3Q6PAQ9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrg3Q6PAQ9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrg3Q6PAQ9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrg3Q6PAQ9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrg3Q6PAQ9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrg3Q6PAQ9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrg3Q6PAQ9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrg3Q6PAQ9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrg3Q6PAQ9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrg3Q6PAQ9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrg3Q6PAQ9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrg3Q6PAQ9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrg3Q6PAQ9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrg3Q6PAQ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prrg3Q6PAQ9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prrg3Q6PAQ9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prrg3Q6PAQ9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prrg3Q6PAQ9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prrg3Q6PAQ9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prrg3Q6PAQ9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prrg3Q6PAQ9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prrg3Q6PAQ9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prrg3Q6PAQ9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrg3Q6PAQ9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrg3Q6PAQ9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrg3Q6PAQ9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrg3Q6PAQ9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrg3Q6PAQ9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrg3Q6PAQ9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrg3Q6PAQ9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrg3Q6PAQ9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrg3Q6PAQ9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrg3Q6PAQ9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrg3Q6PAQ9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrg3Q6PAQ9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrg3Q6PAQ9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrg3Q6PAQ9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrg3Q6PAQ9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrg3Q6PAQ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrg3Q6PAQ9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrg3Q6PAQ9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrg3Q6PAQ9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrg3Q6PAQ9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrg3Q6PAQ9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrg3Q6PAQ9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrg3Q6PAQ9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrg3Q6PAQ9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrg3Q6PAQ9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrg3Q6PAQ9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrg3Q6PAQ9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrg3Q6PAQ9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrg3Q6PAQ9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrg3Q6PAQ9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrg3Q6PAQ9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrg3Q6PAQ9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrg3Q6PAQ9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrg3Q6PAQ9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrg3Q6PAQ9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrg3Q6PAQ9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrg3Q6PAQ9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrg3Q6PAQ9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrg3Q6PAQ9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prrg3Q6PAQ9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prrg3Q6PAQ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prrg3Q6PAQ9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prrg3Q6PAQ9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrg3Q6PAQ9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrg3Q6PAQ9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrg3Q6PAQ9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrg3Q6PAQ9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrg3Q6PAQ9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrg3Q6PAQ9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrg3Q6PAQ9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrg3Q6PAQ9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrg3Q6PAQ9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrg3Q6PAQ9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrg3Q6PAQ9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrg3Q6PAQ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrg3Q6PAQ9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrg3Q6PAQ9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrg3Q6PAQ9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrg3Q6PAQ9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrg3Q6PAQ9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prrg3Q6PAQ9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prrg3Q6PAQ9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrg3Q6PAQ9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrg3Q6PAQ9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrg3Q6PAQ9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrg3Q6PAQ9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrg3Q6PAQ9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrg3Q6PAQ9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrg3Q6PAQ9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrg3Q6PAQ9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrg3Q6PAQ9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms