Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atl2Q6PA06 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atl2Q6PA06 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atl2Q6PA06 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atl2Q6PA06 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atl2Q6PA06 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Atl2Q6PA06 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atl2Q6PA06 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atl2Q6PA06 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atl2Q6PA06 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atl2Q6PA06 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atl2Q6PA06 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atl2Q6PA06 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atl2Q6PA06 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atl2Q6PA06 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atl2Q6PA06 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atl2Q6PA06 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atl2Q6PA06 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atl2Q6PA06 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atl2Q6PA06 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atl2Q6PA06 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atl2Q6PA06 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atl2Q6PA06 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atl2Q6PA06 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atl2Q6PA06 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atl2Q6PA06 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atl2Q6PA06 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atl2Q6PA06 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atl2Q6PA06 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atl2Q6PA06 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atl2Q6PA06 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atl2Q6PA06 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atl2Q6PA06 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atl2Q6PA06 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atl2Q6PA06 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atl2Q6PA06 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atl2Q6PA06 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atl2Q6PA06 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atl2Q6PA06 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atl2Q6PA06 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atl2Q6PA06 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atl2Q6PA06 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atl2Q6PA06 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atl2Q6PA06 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atl2Q6PA06 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atl2Q6PA06 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atl2Q6PA06 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atl2Q6PA06 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atl2Q6PA06 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atl2Q6PA06 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atl2Q6PA06 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atl2Q6PA06 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atl2Q6PA06 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atl2Q6PA06 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atl2Q6PA06 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atl2Q6PA06 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atl2Q6PA06 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atl2Q6PA06 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atl2Q6PA06 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atl2Q6PA06 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atl2Q6PA06 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atl2Q6PA06 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atl2Q6PA06 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atl2Q6PA06 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atl2Q6PA06 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atl2Q6PA06 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atl2Q6PA06 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atl2Q6PA06 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Atl2Q6PA06 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atl2Q6PA06 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atl2Q6PA06 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atl2Q6PA06 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atl2Q6PA06 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atl2Q6PA06 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atl2Q6PA06 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atl2Q6PA06 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atl2Q6PA06 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atl2Q6PA06 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atl2Q6PA06 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atl2Q6PA06 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atl2Q6PA06 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atl2Q6PA06 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atl2Q6PA06 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Atl2Q6PA06 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atl2Q6PA06 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atl2Q6PA06 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atl2Q6PA06 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atl2Q6PA06 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Atl2Q6PA06 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atl2Q6PA06 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atl2Q6PA06 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atl2Q6PA06 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atl2Q6PA06 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atl2Q6PA06 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atl2Q6PA06 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atl2Q6PA06 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atl2Q6PA06 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atl2Q6PA06 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atl2Q6PA06 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atl2Q6PA06 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms