Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gpbp1l1Q6NZP2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gpbp1l1Q6NZP2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gpbp1l1Q6NZP2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gpbp1l1Q6NZP2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gpbp1l1Q6NZP2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gpbp1l1Q6NZP2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gpbp1l1Q6NZP2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gpbp1l1Q6NZP2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gpbp1l1Q6NZP2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gpbp1l1Q6NZP2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gpbp1l1Q6NZP2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gpbp1l1Q6NZP2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gpbp1l1Q6NZP2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gpbp1l1Q6NZP2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gpbp1l1Q6NZP2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gpbp1l1Q6NZP2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gpbp1l1Q6NZP2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gpbp1l1Q6NZP2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gpbp1l1Q6NZP2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gpbp1l1Q6NZP2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms