Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Thsd7aQ69ZU6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Thsd7aQ69ZU6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Thsd7aQ69ZU6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Thsd7aQ69ZU6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Thsd7aQ69ZU6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Thsd7aQ69ZU6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Thsd7aQ69ZU6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Thsd7aQ69ZU6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Thsd7aQ69ZU6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Thsd7aQ69ZU6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Thsd7aQ69ZU6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Thsd7aQ69ZU6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Thsd7aQ69ZU6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Thsd7aQ69ZU6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Thsd7aQ69ZU6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Thsd7aQ69ZU6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Thsd7aQ69ZU6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Thsd7aQ69ZU6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Thsd7aQ69ZU6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Thsd7aQ69ZU6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Thsd7aQ69ZU6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Thsd7aQ69ZU6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Thsd7aQ69ZU6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Thsd7aQ69ZU6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Thsd7aQ69ZU6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Thsd7aQ69ZU6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Thsd7aQ69ZU6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Thsd7aQ69ZU6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Thsd7aQ69ZU6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Thsd7aQ69ZU6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Thsd7aQ69ZU6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Thsd7aQ69ZU6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Thsd7aQ69ZU6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Thsd7aQ69ZU6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Thsd7aQ69ZU6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Thsd7aQ69ZU6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Thsd7aQ69ZU6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Thsd7aQ69ZU6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Thsd7aQ69ZU6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Thsd7aQ69ZU6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Thsd7aQ69ZU6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Thsd7aQ69ZU6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Thsd7aQ69ZU6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Thsd7aQ69ZU6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Thsd7aQ69ZU6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Thsd7aQ69ZU6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Thsd7aQ69ZU6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Thsd7aQ69ZU6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Thsd7aQ69ZU6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Thsd7aQ69ZU6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Thsd7aQ69ZU6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Thsd7aQ69ZU6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Thsd7aQ69ZU6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Thsd7aQ69ZU6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Thsd7aQ69ZU6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Thsd7aQ69ZU6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Thsd7aQ69ZU6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Thsd7aQ69ZU6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Thsd7aQ69ZU6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Thsd7aQ69ZU6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Thsd7aQ69ZU6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Thsd7aQ69ZU6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Thsd7aQ69ZU6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Thsd7aQ69ZU6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Thsd7aQ69ZU6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Thsd7aQ69ZU6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Thsd7aQ69ZU6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Thsd7aQ69ZU6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Thsd7aQ69ZU6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Thsd7aQ69ZU6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Thsd7aQ69ZU6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Thsd7aQ69ZU6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Thsd7aQ69ZU6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Thsd7aQ69ZU6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Thsd7aQ69ZU6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Thsd7aQ69ZU6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Thsd7aQ69ZU6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Thsd7aQ69ZU6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Thsd7aQ69ZU6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Thsd7aQ69ZU6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Thsd7aQ69ZU6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Thsd7aQ69ZU6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Thsd7aQ69ZU6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Thsd7aQ69ZU6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Thsd7aQ69ZU6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Thsd7aQ69ZU6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Thsd7aQ69ZU6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Thsd7aQ69ZU6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Thsd7aQ69ZU6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Thsd7aQ69ZU6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Thsd7aQ69ZU6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Thsd7aQ69ZU6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Thsd7aQ69ZU6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Thsd7aQ69ZU6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Thsd7aQ69ZU6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Thsd7aQ69ZU6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Thsd7aQ69ZU6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Thsd7aQ69ZU6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms