Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Ctnna3Q65CL1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Ctnna3Q65CL1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Ctnna3Q65CL1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Ctnna3Q65CL1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Ctnna3Q65CL1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Ctnna3Q65CL1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Ctnna3Q65CL1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Ctnna3Q65CL1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Ctnna3Q65CL1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Ctnna3Q65CL1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Ctnna3Q65CL1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Ctnna3Q65CL1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Ctnna3Q65CL1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27,19■■□□□ 1,94
Ctnna3Q65CL1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Ctnna3Q65CL1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Ctnna3Q65CL1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Ctnna3Q65CL1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Ctnna3Q65CL1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Ctnna3Q65CL1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Ctnna3Q65CL1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Ctnna3Q65CL1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Ctnna3Q65CL1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Ctnna3Q65CL1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Ctnna3Q65CL1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Ctnna3Q65CL1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Ctnna3Q65CL1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Ctnna3Q65CL1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27,09■■□□□ 1,93
Ctnna3Q65CL1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Ctnna3Q65CL1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Ctnna3Q65CL1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Ctnna3Q65CL1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Ctnna3Q65CL1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Ctnna3Q65CL1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Ctnna3Q65CL1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ctnna3Q65CL1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ctnna3Q65CL1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ctnna3Q65CL1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Ctnna3Q65CL1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Ctnna3Q65CL1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Ctnna3Q65CL1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Ctnna3Q65CL1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Ctnna3Q65CL1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Ctnna3Q65CL1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ctnna3Q65CL1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ctnna3Q65CL1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Ctnna3Q65CL1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Ctnna3Q65CL1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Ctnna3Q65CL1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ctnna3Q65CL1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26,97■■□□□ 1,91
Ctnna3Q65CL1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ctnna3Q65CL1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,95■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26,93■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Ctnna3Q65CL1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26,89■■□□□ 1,89
Ctnna3Q65CL1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26,88■■□□□ 1,89
Ctnna3Q65CL1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Ctnna3Q65CL1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ctnna3Q65CL1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Ctnna3Q65CL1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26,86■■□□□ 1,89
Ctnna3Q65CL1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Ctnna3Q65CL1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26,85■■□□□ 1,89
Ctnna3Q65CL1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Ctnna3Q65CL1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Ctnna3Q65CL1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Ctnna3Q65CL1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Ctnna3Q65CL1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ctnna3Q65CL1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ctnna3Q65CL1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ctnna3Q65CL1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ctnna3Q65CL1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ctnna3Q65CL1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ctnna3Q65CL1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Ctnna3Q65CL1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Ctnna3Q65CL1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ctnna3Q65CL1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ctnna3Q65CL1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ctnna3Q65CL1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms