Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcg1Q64343 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcg1Q64343 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcg1Q64343 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcg1Q64343 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcg1Q64343 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcg1Q64343 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcg1Q64343 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcg1Q64343 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcg1Q64343 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcg1Q64343 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcg1Q64343 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcg1Q64343 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcg1Q64343 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcg1Q64343 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcg1Q64343 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcg1Q64343 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcg1Q64343 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcg1Q64343 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcg1Q64343 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcg1Q64343 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcg1Q64343 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcg1Q64343 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcg1Q64343 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcg1Q64343 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcg1Q64343 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcg1Q64343 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcg1Q64343 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcg1Q64343 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcg1Q64343 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcg1Q64343 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcg1Q64343 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcg1Q64343 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcg1Q64343 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcg1Q64343 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcg1Q64343 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcg1Q64343 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcg1Q64343 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcg1Q64343 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcg1Q64343 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcg1Q64343 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcg1Q64343 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcg1Q64343 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcg1Q64343 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcg1Q64343 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcg1Q64343 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcg1Q64343 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcg1Q64343 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Abcg1Q64343 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcg1Q64343 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcg1Q64343 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcg1Q64343 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcg1Q64343 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcg1Q64343 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcg1Q64343 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcg1Q64343 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcg1Q64343 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcg1Q64343 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcg1Q64343 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcg1Q64343 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcg1Q64343 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcg1Q64343 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcg1Q64343 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcg1Q64343 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcg1Q64343 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcg1Q64343 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcg1Q64343 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcg1Q64343 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcg1Q64343 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcg1Q64343 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcg1Q64343 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcg1Q64343 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcg1Q64343 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcg1Q64343 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcg1Q64343 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcg1Q64343 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcg1Q64343 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcg1Q64343 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcg1Q64343 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcg1Q64343 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcg1Q64343 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcg1Q64343 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcg1Q64343 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcg1Q64343 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcg1Q64343 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcg1Q64343 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcg1Q64343 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcg1Q64343 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcg1Q64343 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcg1Q64343 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcg1Q64343 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcg1Q64343 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcg1Q64343 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcg1Q64343 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcg1Q64343 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcg1Q64343 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcg1Q64343 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcg1Q64343 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcg1Q64343 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcg1Q64343 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms