Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Ccdc18Q640L5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
Ccdc18Q640L5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Ccdc18Q640L5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Ccdc18Q640L5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
Ccdc18Q640L5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Ccdc18Q640L5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Ccdc18Q640L5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Ccdc18Q640L5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC41.35■■■■■ 4.21
Ccdc18Q640L5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Ccdc18Q640L5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
Ccdc18Q640L5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Ccdc18Q640L5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Ccdc18Q640L5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Ccdc18Q640L5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Ccdc18Q640L5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Ccdc18Q640L5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Ccdc18Q640L5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
Ccdc18Q640L5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
Ccdc18Q640L5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Ccdc18Q640L5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
Ccdc18Q640L5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Ccdc18Q640L5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Ccdc18Q640L5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Ccdc18Q640L5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Ccdc18Q640L5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Ccdc18Q640L5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Ccdc18Q640L5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Ccdc18Q640L5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Ccdc18Q640L5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Ccdc18Q640L5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Ccdc18Q640L5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Ccdc18Q640L5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Ccdc18Q640L5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Ccdc18Q640L5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Ccdc18Q640L5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
Ccdc18Q640L5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Ccdc18Q640L5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Ccdc18Q640L5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.16
Ccdc18Q640L5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
Ccdc18Q640L5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
Ccdc18Q640L5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Ccdc18Q640L5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Ccdc18Q640L5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC41■■■■■ 4.15
Ccdc18Q640L5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Ccdc18Q640L5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
Ccdc18Q640L5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Ccdc18Q640L5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
Ccdc18Q640L5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Ccdc18Q640L5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Ccdc18Q640L5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Ccdc18Q640L5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
Ccdc18Q640L5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Ccdc18Q640L5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Ccdc18Q640L5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Ccdc18Q640L5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Ccdc18Q640L5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
Ccdc18Q640L5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Ccdc18Q640L5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
Ccdc18Q640L5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Ccdc18Q640L5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
Ccdc18Q640L5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
Ccdc18Q640L5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Ccdc18Q640L5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Ccdc18Q640L5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Ccdc18Q640L5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Ccdc18Q640L5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Ccdc18Q640L5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Ccdc18Q640L5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Ccdc18Q640L5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Ccdc18Q640L5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Ccdc18Q640L5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Ccdc18Q640L5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Ccdc18Q640L5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Ccdc18Q640L5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Ccdc18Q640L5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Ccdc18Q640L5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Ccdc18Q640L5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Ccdc18Q640L5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Ccdc18Q640L5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Ccdc18Q640L5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Ccdc18Q640L5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
Ccdc18Q640L5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Ccdc18Q640L5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Ccdc18Q640L5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Ccdc18Q640L5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Ccdc18Q640L5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Ccdc18Q640L5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Ccdc18Q640L5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Ccdc18Q640L5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Ccdc18Q640L5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Ccdc18Q640L5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Ccdc18Q640L5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Ccdc18Q640L5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC40.69■■■■■ 4.1
Ccdc18Q640L5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Ccdc18Q640L5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
Ccdc18Q640L5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Ccdc18Q640L5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Ccdc18Q640L5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Ccdc18Q640L5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
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