Protein–RNA interactions for Protein: Q62469

Itga2, Integrin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga2Q62469 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga2Q62469 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga2Q62469 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga2Q62469 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga2Q62469 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga2Q62469 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga2Q62469 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga2Q62469 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga2Q62469 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga2Q62469 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga2Q62469 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga2Q62469 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga2Q62469 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga2Q62469 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga2Q62469 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga2Q62469 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itga2Q62469 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga2Q62469 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga2Q62469 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga2Q62469 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga2Q62469 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga2Q62469 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga2Q62469 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga2Q62469 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga2Q62469 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga2Q62469 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga2Q62469 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga2Q62469 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga2Q62469 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga2Q62469 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Itga2Q62469 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Itga2Q62469 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga2Q62469 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga2Q62469 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga2Q62469 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga2Q62469 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga2Q62469 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga2Q62469 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga2Q62469 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga2Q62469 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga2Q62469 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga2Q62469 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga2Q62469 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga2Q62469 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga2Q62469 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga2Q62469 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga2Q62469 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga2Q62469 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga2Q62469 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga2Q62469 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga2Q62469 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga2Q62469 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga2Q62469 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga2Q62469 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga2Q62469 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga2Q62469 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga2Q62469 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga2Q62469 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga2Q62469 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga2Q62469 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga2Q62469 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga2Q62469 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itga2Q62469 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itga2Q62469 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itga2Q62469 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga2Q62469 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga2Q62469 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga2Q62469 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga2Q62469 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga2Q62469 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga2Q62469 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga2Q62469 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga2Q62469 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga2Q62469 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga2Q62469 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga2Q62469 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga2Q62469 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga2Q62469 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga2Q62469 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga2Q62469 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga2Q62469 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga2Q62469 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga2Q62469 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga2Q62469 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga2Q62469 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga2Q62469 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga2Q62469 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga2Q62469 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga2Q62469 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga2Q62469 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga2Q62469 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga2Q62469 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga2Q62469 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga2Q62469 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga2Q62469 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga2Q62469 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga2Q62469 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga2Q62469 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga2Q62469 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga2Q62469 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms