Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Vil1Q62468 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Vil1Q62468 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Vil1Q62468 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Vil1Q62468 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Vil1Q62468 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Vil1Q62468 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Vil1Q62468 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Vil1Q62468 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Vil1Q62468 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Vil1Q62468 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Vil1Q62468 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Vil1Q62468 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Vil1Q62468 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Vil1Q62468 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Vil1Q62468 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Vil1Q62468 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Vil1Q62468 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Vil1Q62468 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Vil1Q62468 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Vil1Q62468 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Vil1Q62468 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Vil1Q62468 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Vil1Q62468 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Vil1Q62468 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Vil1Q62468 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Vil1Q62468 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Vil1Q62468 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Vil1Q62468 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Vil1Q62468 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Vil1Q62468 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Vil1Q62468 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Vil1Q62468 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Vil1Q62468 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Vil1Q62468 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Vil1Q62468 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Vil1Q62468 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Vil1Q62468 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Vil1Q62468 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Vil1Q62468 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Vil1Q62468 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Vil1Q62468 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Vil1Q62468 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Vil1Q62468 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vil1Q62468 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Vil1Q62468 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vil1Q62468 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vil1Q62468 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Vil1Q62468 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vil1Q62468 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Vil1Q62468 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vil1Q62468 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Vil1Q62468 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Vil1Q62468 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Vil1Q62468 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Vil1Q62468 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Vil1Q62468 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Vil1Q62468 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Vil1Q62468 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Vil1Q62468 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Vil1Q62468 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Vil1Q62468 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Vil1Q62468 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Vil1Q62468 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Vil1Q62468 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Vil1Q62468 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Vil1Q62468 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Vil1Q62468 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Vil1Q62468 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Vil1Q62468 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Vil1Q62468 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Vil1Q62468 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Vil1Q62468 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Vil1Q62468 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Vil1Q62468 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Vil1Q62468 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Vil1Q62468 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Vil1Q62468 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Vil1Q62468 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vil1Q62468 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vil1Q62468 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vil1Q62468 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vil1Q62468 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vil1Q62468 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vil1Q62468 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Vil1Q62468 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Vil1Q62468 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Vil1Q62468 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Vil1Q62468 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Vil1Q62468 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Vil1Q62468 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Vil1Q62468 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Vil1Q62468 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Vil1Q62468 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Vil1Q62468 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Vil1Q62468 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Vil1Q62468 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Vil1Q62468 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Vil1Q62468 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Vil1Q62468 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms