Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccl12Q62401 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccl12Q62401 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccl12Q62401 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccl12Q62401 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccl12Q62401 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccl12Q62401 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccl12Q62401 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccl12Q62401 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccl12Q62401 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccl12Q62401 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccl12Q62401 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccl12Q62401 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccl12Q62401 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccl12Q62401 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccl12Q62401 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccl12Q62401 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl12Q62401 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccl12Q62401 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccl12Q62401 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccl12Q62401 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccl12Q62401 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccl12Q62401 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccl12Q62401 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccl12Q62401 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccl12Q62401 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccl12Q62401 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccl12Q62401 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccl12Q62401 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccl12Q62401 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms