Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf6Q62311 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf6Q62311 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf6Q62311 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf6Q62311 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf6Q62311 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf6Q62311 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf6Q62311 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf6Q62311 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf6Q62311 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf6Q62311 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf6Q62311 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf6Q62311 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf6Q62311 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf6Q62311 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf6Q62311 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf6Q62311 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf6Q62311 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf6Q62311 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf6Q62311 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf6Q62311 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf6Q62311 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf6Q62311 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf6Q62311 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf6Q62311 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf6Q62311 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf6Q62311 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf6Q62311 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf6Q62311 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf6Q62311 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf6Q62311 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf6Q62311 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf6Q62311 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf6Q62311 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf6Q62311 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf6Q62311 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Taf6Q62311 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf6Q62311 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Taf6Q62311 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Taf6Q62311 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf6Q62311 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf6Q62311 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Taf6Q62311 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf6Q62311 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf6Q62311 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf6Q62311 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf6Q62311 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf6Q62311 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf6Q62311 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf6Q62311 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf6Q62311 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf6Q62311 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf6Q62311 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf6Q62311 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf6Q62311 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf6Q62311 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf6Q62311 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf6Q62311 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf6Q62311 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf6Q62311 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf6Q62311 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf6Q62311 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf6Q62311 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf6Q62311 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf6Q62311 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf6Q62311 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf6Q62311 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf6Q62311 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf6Q62311 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf6Q62311 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf6Q62311 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf6Q62311 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf6Q62311 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf6Q62311 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms