Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sin3bQ62141 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sin3bQ62141 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sin3bQ62141 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sin3bQ62141 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sin3bQ62141 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sin3bQ62141 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sin3bQ62141 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sin3bQ62141 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sin3bQ62141 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sin3bQ62141 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sin3bQ62141 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sin3bQ62141 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sin3bQ62141 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sin3bQ62141 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sin3bQ62141 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sin3bQ62141 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sin3bQ62141 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sin3bQ62141 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sin3bQ62141 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sin3bQ62141 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Sin3bQ62141 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sin3bQ62141 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sin3bQ62141 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sin3bQ62141 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sin3bQ62141 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sin3bQ62141 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sin3bQ62141 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sin3bQ62141 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sin3bQ62141 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sin3bQ62141 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sin3bQ62141 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sin3bQ62141 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sin3bQ62141 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sin3bQ62141 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sin3bQ62141 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sin3bQ62141 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sin3bQ62141 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sin3bQ62141 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sin3bQ62141 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sin3bQ62141 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sin3bQ62141 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sin3bQ62141 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sin3bQ62141 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sin3bQ62141 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sin3bQ62141 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sin3bQ62141 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sin3bQ62141 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sin3bQ62141 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sin3bQ62141 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sin3bQ62141 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sin3bQ62141 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Sin3bQ62141 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sin3bQ62141 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sin3bQ62141 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sin3bQ62141 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sin3bQ62141 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sin3bQ62141 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sin3bQ62141 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sin3bQ62141 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sin3bQ62141 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Sin3bQ62141 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sin3bQ62141 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sin3bQ62141 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sin3bQ62141 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sin3bQ62141 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sin3bQ62141 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sin3bQ62141 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Sin3bQ62141 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sin3bQ62141 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sin3bQ62141 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sin3bQ62141 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sin3bQ62141 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sin3bQ62141 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sin3bQ62141 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sin3bQ62141 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sin3bQ62141 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sin3bQ62141 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sin3bQ62141 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sin3bQ62141 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sin3bQ62141 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sin3bQ62141 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sin3bQ62141 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Sin3bQ62141 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sin3bQ62141 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sin3bQ62141 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sin3bQ62141 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sin3bQ62141 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sin3bQ62141 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sin3bQ62141 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sin3bQ62141 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sin3bQ62141 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sin3bQ62141 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sin3bQ62141 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sin3bQ62141 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sin3bQ62141 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sin3bQ62141 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sin3bQ62141 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sin3bQ62141 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sin3bQ62141 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms