Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vsx2Q61412 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vsx2Q61412 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vsx2Q61412 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vsx2Q61412 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vsx2Q61412 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vsx2Q61412 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vsx2Q61412 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vsx2Q61412 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vsx2Q61412 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vsx2Q61412 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vsx2Q61412 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vsx2Q61412 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vsx2Q61412 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vsx2Q61412 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vsx2Q61412 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vsx2Q61412 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vsx2Q61412 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vsx2Q61412 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vsx2Q61412 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vsx2Q61412 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vsx2Q61412 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vsx2Q61412 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vsx2Q61412 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vsx2Q61412 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vsx2Q61412 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vsx2Q61412 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vsx2Q61412 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vsx2Q61412 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vsx2Q61412 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vsx2Q61412 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vsx2Q61412 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vsx2Q61412 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Vsx2Q61412 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vsx2Q61412 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vsx2Q61412 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vsx2Q61412 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vsx2Q61412 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vsx2Q61412 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vsx2Q61412 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vsx2Q61412 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vsx2Q61412 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vsx2Q61412 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vsx2Q61412 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vsx2Q61412 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vsx2Q61412 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vsx2Q61412 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vsx2Q61412 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vsx2Q61412 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vsx2Q61412 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vsx2Q61412 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vsx2Q61412 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vsx2Q61412 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vsx2Q61412 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vsx2Q61412 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vsx2Q61412 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vsx2Q61412 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vsx2Q61412 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vsx2Q61412 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vsx2Q61412 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vsx2Q61412 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vsx2Q61412 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vsx2Q61412 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Vsx2Q61412 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vsx2Q61412 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vsx2Q61412 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vsx2Q61412 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vsx2Q61412 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vsx2Q61412 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vsx2Q61412 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vsx2Q61412 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vsx2Q61412 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vsx2Q61412 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vsx2Q61412 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vsx2Q61412 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vsx2Q61412 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vsx2Q61412 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vsx2Q61412 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vsx2Q61412 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vsx2Q61412 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vsx2Q61412 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vsx2Q61412 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Vsx2Q61412 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vsx2Q61412 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vsx2Q61412 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vsx2Q61412 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vsx2Q61412 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vsx2Q61412 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vsx2Q61412 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vsx2Q61412 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vsx2Q61412 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vsx2Q61412 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vsx2Q61412 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vsx2Q61412 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vsx2Q61412 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vsx2Q61412 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vsx2Q61412 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vsx2Q61412 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vsx2Q61412 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vsx2Q61412 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms