Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tfap2bQ61313 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tfap2bQ61313 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tfap2bQ61313 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tfap2bQ61313 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tfap2bQ61313 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Tfap2bQ61313 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tfap2bQ61313 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tfap2bQ61313 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tfap2bQ61313 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tfap2bQ61313 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tfap2bQ61313 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tfap2bQ61313 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tfap2bQ61313 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tfap2bQ61313 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tfap2bQ61313 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tfap2bQ61313 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tfap2bQ61313 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tfap2bQ61313 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tfap2bQ61313 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tfap2bQ61313 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tfap2bQ61313 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tfap2bQ61313 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tfap2bQ61313 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tfap2bQ61313 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tfap2bQ61313 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tfap2bQ61313 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tfap2bQ61313 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tfap2bQ61313 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tfap2bQ61313 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tfap2bQ61313 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tfap2bQ61313 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tfap2bQ61313 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tfap2bQ61313 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tfap2bQ61313 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tfap2bQ61313 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tfap2bQ61313 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tfap2bQ61313 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tfap2bQ61313 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tfap2bQ61313 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tfap2bQ61313 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tfap2bQ61313 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tfap2bQ61313 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tfap2bQ61313 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tfap2bQ61313 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfap2bQ61313 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfap2bQ61313 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfap2bQ61313 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfap2bQ61313 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tfap2bQ61313 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tfap2bQ61313 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tfap2bQ61313 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfap2bQ61313 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfap2bQ61313 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfap2bQ61313 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tfap2bQ61313 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tfap2bQ61313 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfap2bQ61313 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfap2bQ61313 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfap2bQ61313 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfap2bQ61313 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfap2bQ61313 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfap2bQ61313 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfap2bQ61313 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfap2bQ61313 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfap2bQ61313 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfap2bQ61313 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfap2bQ61313 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfap2bQ61313 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfap2bQ61313 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfap2bQ61313 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfap2bQ61313 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfap2bQ61313 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfap2bQ61313 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfap2bQ61313 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfap2bQ61313 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfap2bQ61313 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tfap2bQ61313 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tfap2bQ61313 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tfap2bQ61313 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tfap2bQ61313 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tfap2bQ61313 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tfap2bQ61313 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tfap2bQ61313 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfap2bQ61313 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfap2bQ61313 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfap2bQ61313 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfap2bQ61313 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tfap2bQ61313 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tfap2bQ61313 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tfap2bQ61313 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tfap2bQ61313 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tfap2bQ61313 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tfap2bQ61313 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tfap2bQ61313 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tfap2bQ61313 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tfap2bQ61313 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tfap2bQ61313 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tfap2bQ61313 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tfap2bQ61313 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms