Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbbp4Q60972 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbbp4Q60972 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp4Q60972 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp4Q60972 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp4Q60972 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbbp4Q60972 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbbp4Q60972 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbbp4Q60972 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbbp4Q60972 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbbp4Q60972 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbbp4Q60972 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbbp4Q60972 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp4Q60972 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp4Q60972 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp4Q60972 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp4Q60972 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp4Q60972 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp4Q60972 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp4Q60972 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp4Q60972 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbbp4Q60972 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbbp4Q60972 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbbp4Q60972 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbbp4Q60972 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbbp4Q60972 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbbp4Q60972 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbbp4Q60972 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbbp4Q60972 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbbp4Q60972 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbbp4Q60972 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp4Q60972 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp4Q60972 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp4Q60972 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp4Q60972 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp4Q60972 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp4Q60972 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp4Q60972 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp4Q60972 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp4Q60972 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp4Q60972 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp4Q60972 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rbbp4Q60972 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp4Q60972 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp4Q60972 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp4Q60972 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp4Q60972 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp4Q60972 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp4Q60972 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp4Q60972 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbbp4Q60972 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp4Q60972 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp4Q60972 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp4Q60972 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp4Q60972 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp4Q60972 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp4Q60972 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp4Q60972 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp4Q60972 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp4Q60972 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp4Q60972 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp4Q60972 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp4Q60972 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp4Q60972 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp4Q60972 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp4Q60972 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp4Q60972 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp4Q60972 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp4Q60972 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp4Q60972 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp4Q60972 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp4Q60972 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp4Q60972 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp4Q60972 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp4Q60972 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp4Q60972 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp4Q60972 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp4Q60972 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp4Q60972 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp4Q60972 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp4Q60972 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp4Q60972 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp4Q60972 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp4Q60972 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp4Q60972 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp4Q60972 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp4Q60972 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp4Q60972 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp4Q60972 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbbp4Q60972 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp4Q60972 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp4Q60972 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp4Q60972 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp4Q60972 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp4Q60972 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp4Q60972 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp4Q60972 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp4Q60972 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp4Q60972 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp4Q60972 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms