Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep250Q60952 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cep250Q60952 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep250Q60952 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cep250Q60952 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cep250Q60952 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cep250Q60952 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep250Q60952 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep250Q60952 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep250Q60952 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep250Q60952 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cep250Q60952 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cep250Q60952 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep250Q60952 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cep250Q60952 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cep250Q60952 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms