Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23,58■■□□□ 1,36
Cdkn2cQ60772 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Cdkn2cQ60772 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Cdkn2cQ60772 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Cdkn2cQ60772 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Cdkn2cQ60772 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Cdkn2cQ60772 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Cdkn2cQ60772 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23,54■■□□□ 1,36
Cdkn2cQ60772 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Cdkn2cQ60772 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Cdkn2cQ60772 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,53■■□□□ 1,36
Cdkn2cQ60772 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Cdkn2cQ60772 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23,53■■□□□ 1,36
Cdkn2cQ60772 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Cdkn2cQ60772 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,52■■□□□ 1,36
Cdkn2cQ60772 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Cdkn2cQ60772 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23,51■■□□□ 1,35
Cdkn2cQ60772 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Cdkn2cQ60772 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Cdkn2cQ60772 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Cdkn2cQ60772 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Cdkn2cQ60772 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23,49■■□□□ 1,35
Cdkn2cQ60772 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Cdkn2cQ60772 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23,48■■□□□ 1,35
Cdkn2cQ60772 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Cdkn2cQ60772 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Cdkn2cQ60772 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Cdkn2cQ60772 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,46■■□□□ 1,35
Cdkn2cQ60772 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Cdkn2cQ60772 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,45■■□□□ 1,34
Cdkn2cQ60772 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23,45■■□□□ 1,34
Cdkn2cQ60772 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23,45■■□□□ 1,34
Cdkn2cQ60772 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23,45■■□□□ 1,34
Cdkn2cQ60772 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Cdkn2cQ60772 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Cdkn2cQ60772 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23,44■■□□□ 1,34
Cdkn2cQ60772 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Cdkn2cQ60772 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Cdkn2cQ60772 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Cdkn2cQ60772 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Cdkn2cQ60772 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Cdkn2cQ60772 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Cdkn2cQ60772 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Cdkn2cQ60772 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Cdkn2cQ60772 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23,41■■□□□ 1,34
Cdkn2cQ60772 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23,41■■□□□ 1,34
Cdkn2cQ60772 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Cdkn2cQ60772 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Cdkn2cQ60772 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Cdkn2cQ60772 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Cdkn2cQ60772 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Cdkn2cQ60772 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23,37■■□□□ 1,33
Cdkn2cQ60772 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Cdkn2cQ60772 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,36■■□□□ 1,33
Cdkn2cQ60772 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,35■■□□□ 1,33
Cdkn2cQ60772 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23,35■■□□□ 1,33
Cdkn2cQ60772 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Cdkn2cQ60772 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Cdkn2cQ60772 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23,33■■□□□ 1,33
Cdkn2cQ60772 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Cdkn2cQ60772 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,33■■□□□ 1,32
Cdkn2cQ60772 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,32■■□□□ 1,32
Cdkn2cQ60772 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Cdkn2cQ60772 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Cdkn2cQ60772 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23,3■■□□□ 1,32
Cdkn2cQ60772 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23,3■■□□□ 1,32
Cdkn2cQ60772 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Cdkn2cQ60772 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Cdkn2cQ60772 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Cdkn2cQ60772 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Cdkn2cQ60772 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Cdkn2cQ60772 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Cdkn2cQ60772 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Cdkn2cQ60772 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,27■■□□□ 1,32
Cdkn2cQ60772 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Cdkn2cQ60772 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Cdkn2cQ60772 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Cdkn2cQ60772 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Cdkn2cQ60772 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Cdkn2cQ60772 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Cdkn2cQ60772 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Cdkn2cQ60772 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23,24■■□□□ 1,31
Cdkn2cQ60772 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Cdkn2cQ60772 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Cdkn2cQ60772 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Cdkn2cQ60772 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Cdkn2cQ60772 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Cdkn2cQ60772 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Cdkn2cQ60772 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Cdkn2cQ60772 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Cdkn2cQ60772 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Cdkn2cQ60772 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Cdkn2cQ60772 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23,2■■□□□ 1,3
Cdkn2cQ60772 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Cdkn2cQ60772 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Cdkn2cQ60772 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Cdkn2cQ60772 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Cdkn2cQ60772 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Cdkn2cQ60772 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Cdkn2cQ60772 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,8 ms