Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Specc1Q5SXY1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Specc1Q5SXY1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Specc1Q5SXY1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Specc1Q5SXY1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Specc1Q5SXY1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Specc1Q5SXY1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Specc1Q5SXY1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Specc1Q5SXY1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Specc1Q5SXY1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Specc1Q5SXY1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Specc1Q5SXY1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Specc1Q5SXY1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Specc1Q5SXY1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Specc1Q5SXY1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Specc1Q5SXY1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Specc1Q5SXY1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Specc1Q5SXY1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Specc1Q5SXY1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Specc1Q5SXY1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Specc1Q5SXY1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Specc1Q5SXY1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Specc1Q5SXY1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Specc1Q5SXY1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Specc1Q5SXY1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Specc1Q5SXY1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Specc1Q5SXY1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Specc1Q5SXY1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Specc1Q5SXY1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Specc1Q5SXY1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Specc1Q5SXY1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Specc1Q5SXY1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Specc1Q5SXY1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Specc1Q5SXY1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Specc1Q5SXY1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Specc1Q5SXY1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Specc1Q5SXY1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Specc1Q5SXY1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Specc1Q5SXY1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Specc1Q5SXY1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Specc1Q5SXY1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Specc1Q5SXY1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Specc1Q5SXY1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Specc1Q5SXY1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Specc1Q5SXY1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Specc1Q5SXY1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Specc1Q5SXY1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Specc1Q5SXY1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Specc1Q5SXY1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Specc1Q5SXY1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Specc1Q5SXY1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Specc1Q5SXY1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Specc1Q5SXY1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Specc1Q5SXY1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Specc1Q5SXY1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Specc1Q5SXY1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Specc1Q5SXY1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Specc1Q5SXY1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Specc1Q5SXY1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Specc1Q5SXY1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Specc1Q5SXY1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Specc1Q5SXY1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Specc1Q5SXY1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Specc1Q5SXY1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Specc1Q5SXY1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Specc1Q5SXY1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Specc1Q5SXY1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Specc1Q5SXY1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Specc1Q5SXY1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Specc1Q5SXY1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Specc1Q5SXY1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Specc1Q5SXY1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Specc1Q5SXY1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Specc1Q5SXY1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Specc1Q5SXY1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Specc1Q5SXY1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Specc1Q5SXY1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Specc1Q5SXY1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Specc1Q5SXY1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Specc1Q5SXY1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Specc1Q5SXY1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Specc1Q5SXY1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Specc1Q5SXY1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Specc1Q5SXY1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Specc1Q5SXY1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Specc1Q5SXY1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Specc1Q5SXY1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Specc1Q5SXY1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Specc1Q5SXY1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Specc1Q5SXY1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Specc1Q5SXY1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Specc1Q5SXY1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Specc1Q5SXY1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Specc1Q5SXY1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Specc1Q5SXY1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Specc1Q5SXY1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Specc1Q5SXY1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Specc1Q5SXY1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Specc1Q5SXY1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Specc1Q5SXY1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms