Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r196Q5SVD5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r196Q5SVD5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r196Q5SVD5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r196Q5SVD5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r196Q5SVD5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r196Q5SVD5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r196Q5SVD5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r196Q5SVD5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r196Q5SVD5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r196Q5SVD5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r196Q5SVD5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r196Q5SVD5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r196Q5SVD5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r196Q5SVD5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r196Q5SVD5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r196Q5SVD5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r196Q5SVD5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r196Q5SVD5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r196Q5SVD5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r196Q5SVD5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r196Q5SVD5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r196Q5SVD5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r196Q5SVD5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r196Q5SVD5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r196Q5SVD5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r196Q5SVD5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r196Q5SVD5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r196Q5SVD5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r196Q5SVD5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r196Q5SVD5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r196Q5SVD5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r196Q5SVD5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r196Q5SVD5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r196Q5SVD5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r196Q5SVD5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r196Q5SVD5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r196Q5SVD5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r196Q5SVD5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r196Q5SVD5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r196Q5SVD5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vmn1r196Q5SVD5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r196Q5SVD5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r196Q5SVD5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r196Q5SVD5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r196Q5SVD5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r196Q5SVD5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r196Q5SVD5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r196Q5SVD5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r196Q5SVD5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r196Q5SVD5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r196Q5SVD5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r196Q5SVD5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r196Q5SVD5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r196Q5SVD5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r196Q5SVD5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r196Q5SVD5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r196Q5SVD5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r196Q5SVD5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r196Q5SVD5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r196Q5SVD5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r196Q5SVD5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r196Q5SVD5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r196Q5SVD5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r196Q5SVD5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r196Q5SVD5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r196Q5SVD5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r196Q5SVD5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r196Q5SVD5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r196Q5SVD5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r196Q5SVD5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r196Q5SVD5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r196Q5SVD5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r196Q5SVD5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r196Q5SVD5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r196Q5SVD5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r196Q5SVD5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r196Q5SVD5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r196Q5SVD5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r196Q5SVD5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r196Q5SVD5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r196Q5SVD5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r196Q5SVD5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r196Q5SVD5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r196Q5SVD5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r196Q5SVD5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r196Q5SVD5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r196Q5SVD5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r196Q5SVD5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms