Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctc1Q5SUQ9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctc1Q5SUQ9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctc1Q5SUQ9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ctc1Q5SUQ9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctc1Q5SUQ9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctc1Q5SUQ9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctc1Q5SUQ9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctc1Q5SUQ9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ctc1Q5SUQ9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctc1Q5SUQ9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ctc1Q5SUQ9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ctc1Q5SUQ9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ctc1Q5SUQ9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ctc1Q5SUQ9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ctc1Q5SUQ9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctc1Q5SUQ9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctc1Q5SUQ9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctc1Q5SUQ9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctc1Q5SUQ9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctc1Q5SUQ9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctc1Q5SUQ9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctc1Q5SUQ9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctc1Q5SUQ9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctc1Q5SUQ9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctc1Q5SUQ9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctc1Q5SUQ9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctc1Q5SUQ9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctc1Q5SUQ9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctc1Q5SUQ9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctc1Q5SUQ9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctc1Q5SUQ9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctc1Q5SUQ9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctc1Q5SUQ9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctc1Q5SUQ9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctc1Q5SUQ9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctc1Q5SUQ9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctc1Q5SUQ9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctc1Q5SUQ9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctc1Q5SUQ9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctc1Q5SUQ9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctc1Q5SUQ9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctc1Q5SUQ9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ctc1Q5SUQ9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctc1Q5SUQ9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctc1Q5SUQ9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctc1Q5SUQ9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctc1Q5SUQ9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctc1Q5SUQ9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctc1Q5SUQ9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctc1Q5SUQ9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctc1Q5SUQ9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctc1Q5SUQ9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctc1Q5SUQ9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctc1Q5SUQ9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctc1Q5SUQ9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctc1Q5SUQ9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctc1Q5SUQ9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctc1Q5SUQ9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctc1Q5SUQ9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctc1Q5SUQ9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctc1Q5SUQ9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctc1Q5SUQ9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctc1Q5SUQ9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctc1Q5SUQ9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctc1Q5SUQ9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ctc1Q5SUQ9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ctc1Q5SUQ9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctc1Q5SUQ9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctc1Q5SUQ9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctc1Q5SUQ9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctc1Q5SUQ9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctc1Q5SUQ9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctc1Q5SUQ9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctc1Q5SUQ9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctc1Q5SUQ9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctc1Q5SUQ9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctc1Q5SUQ9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctc1Q5SUQ9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctc1Q5SUQ9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctc1Q5SUQ9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctc1Q5SUQ9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctc1Q5SUQ9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctc1Q5SUQ9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctc1Q5SUQ9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctc1Q5SUQ9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctc1Q5SUQ9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctc1Q5SUQ9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctc1Q5SUQ9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctc1Q5SUQ9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctc1Q5SUQ9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctc1Q5SUQ9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctc1Q5SUQ9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctc1Q5SUQ9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctc1Q5SUQ9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctc1Q5SUQ9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctc1Q5SUQ9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctc1Q5SUQ9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctc1Q5SUQ9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctc1Q5SUQ9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms