Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znrf3Q5SSZ7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znrf3Q5SSZ7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znrf3Q5SSZ7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znrf3Q5SSZ7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znrf3Q5SSZ7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znrf3Q5SSZ7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znrf3Q5SSZ7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znrf3Q5SSZ7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znrf3Q5SSZ7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Znrf3Q5SSZ7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Znrf3Q5SSZ7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znrf3Q5SSZ7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znrf3Q5SSZ7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Znrf3Q5SSZ7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znrf3Q5SSZ7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znrf3Q5SSZ7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znrf3Q5SSZ7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Znrf3Q5SSZ7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znrf3Q5SSZ7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znrf3Q5SSZ7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znrf3Q5SSZ7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znrf3Q5SSZ7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znrf3Q5SSZ7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Znrf3Q5SSZ7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znrf3Q5SSZ7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znrf3Q5SSZ7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znrf3Q5SSZ7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znrf3Q5SSZ7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znrf3Q5SSZ7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znrf3Q5SSZ7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znrf3Q5SSZ7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znrf3Q5SSZ7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znrf3Q5SSZ7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Znrf3Q5SSZ7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znrf3Q5SSZ7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znrf3Q5SSZ7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znrf3Q5SSZ7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znrf3Q5SSZ7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znrf3Q5SSZ7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znrf3Q5SSZ7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Znrf3Q5SSZ7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znrf3Q5SSZ7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znrf3Q5SSZ7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znrf3Q5SSZ7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znrf3Q5SSZ7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znrf3Q5SSZ7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znrf3Q5SSZ7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znrf3Q5SSZ7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znrf3Q5SSZ7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znrf3Q5SSZ7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znrf3Q5SSZ7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znrf3Q5SSZ7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znrf3Q5SSZ7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znrf3Q5SSZ7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znrf3Q5SSZ7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znrf3Q5SSZ7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znrf3Q5SSZ7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znrf3Q5SSZ7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znrf3Q5SSZ7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znrf3Q5SSZ7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znrf3Q5SSZ7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znrf3Q5SSZ7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znrf3Q5SSZ7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znrf3Q5SSZ7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znrf3Q5SSZ7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znrf3Q5SSZ7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znrf3Q5SSZ7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znrf3Q5SSZ7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znrf3Q5SSZ7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znrf3Q5SSZ7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znrf3Q5SSZ7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Znrf3Q5SSZ7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znrf3Q5SSZ7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znrf3Q5SSZ7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znrf3Q5SSZ7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znrf3Q5SSZ7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znrf3Q5SSZ7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znrf3Q5SSZ7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znrf3Q5SSZ7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znrf3Q5SSZ7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znrf3Q5SSZ7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znrf3Q5SSZ7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Znrf3Q5SSZ7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znrf3Q5SSZ7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znrf3Q5SSZ7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znrf3Q5SSZ7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znrf3Q5SSZ7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znrf3Q5SSZ7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znrf3Q5SSZ7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znrf3Q5SSZ7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znrf3Q5SSZ7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znrf3Q5SSZ7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znrf3Q5SSZ7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znrf3Q5SSZ7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znrf3Q5SSZ7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znrf3Q5SSZ7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znrf3Q5SSZ7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms