Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trav8d-2Q5R1B6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trav8d-2Q5R1B6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trav8d-2Q5R1B6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trav8d-2Q5R1B6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trav8d-2Q5R1B6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trav8d-2Q5R1B6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trav8d-2Q5R1B6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Trav8d-2Q5R1B6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Trav8d-2Q5R1B6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trav8d-2Q5R1B6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trav8d-2Q5R1B6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trav8d-2Q5R1B6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trav8d-2Q5R1B6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trav8d-2Q5R1B6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trav8d-2Q5R1B6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trav8d-2Q5R1B6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trav8d-2Q5R1B6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trav8d-2Q5R1B6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trav8d-2Q5R1B6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trav8d-2Q5R1B6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trav8d-2Q5R1B6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trav8d-2Q5R1B6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trav8d-2Q5R1B6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trav8d-2Q5R1B6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trav8d-2Q5R1B6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trav8d-2Q5R1B6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trav8d-2Q5R1B6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trav8d-2Q5R1B6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trav8d-2Q5R1B6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trav8d-2Q5R1B6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trav8d-2Q5R1B6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trav8d-2Q5R1B6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trav8d-2Q5R1B6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trav8d-2Q5R1B6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trav8d-2Q5R1B6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trav8d-2Q5R1B6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trav8d-2Q5R1B6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trav8d-2Q5R1B6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trav8d-2Q5R1B6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trav8d-2Q5R1B6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trav8d-2Q5R1B6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trav8d-2Q5R1B6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trav8d-2Q5R1B6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trav8d-2Q5R1B6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trav8d-2Q5R1B6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trav8d-2Q5R1B6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trav8d-2Q5R1B6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trav8d-2Q5R1B6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trav8d-2Q5R1B6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trav8d-2Q5R1B6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trav8d-2Q5R1B6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trav8d-2Q5R1B6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trav8d-2Q5R1B6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trav8d-2Q5R1B6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trav8d-2Q5R1B6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trav8d-2Q5R1B6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trav8d-2Q5R1B6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trav8d-2Q5R1B6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trav8d-2Q5R1B6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trav8d-2Q5R1B6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trav8d-2Q5R1B6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trav8d-2Q5R1B6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trav8d-2Q5R1B6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trav8d-2Q5R1B6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trav8d-2Q5R1B6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trav8d-2Q5R1B6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trav8d-2Q5R1B6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trav8d-2Q5R1B6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trav8d-2Q5R1B6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trav8d-2Q5R1B6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trav8d-2Q5R1B6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trav8d-2Q5R1B6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trav8d-2Q5R1B6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trav8d-2Q5R1B6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trav8d-2Q5R1B6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trav8d-2Q5R1B6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trav8d-2Q5R1B6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trav8d-2Q5R1B6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trav8d-2Q5R1B6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trav8d-2Q5R1B6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trav8d-2Q5R1B6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trav8d-2Q5R1B6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trav8d-2Q5R1B6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trav8d-2Q5R1B6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trav8d-2Q5R1B6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trav8d-2Q5R1B6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trav8d-2Q5R1B6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trav8d-2Q5R1B6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trav8d-2Q5R1B6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trav8d-2Q5R1B6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trav8d-2Q5R1B6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trav8d-2Q5R1B6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trav8d-2Q5R1B6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trav8d-2Q5R1B6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trav8d-2Q5R1B6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trav8d-2Q5R1B6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trav8d-2Q5R1B6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trav8d-2Q5R1B6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 343.9 ms