Protein–RNA interactions for Protein: Q5QNQ9

Col27a1, Collagen alpha-1(XXVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col27a1Q5QNQ9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col27a1Q5QNQ9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Col27a1Q5QNQ9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col27a1Q5QNQ9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col27a1Q5QNQ9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col27a1Q5QNQ9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col27a1Q5QNQ9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col27a1Q5QNQ9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Col27a1Q5QNQ9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col27a1Q5QNQ9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Col27a1Q5QNQ9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col27a1Q5QNQ9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col27a1Q5QNQ9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col27a1Q5QNQ9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col27a1Q5QNQ9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col27a1Q5QNQ9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col27a1Q5QNQ9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col27a1Q5QNQ9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col27a1Q5QNQ9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col27a1Q5QNQ9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col27a1Q5QNQ9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col27a1Q5QNQ9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col27a1Q5QNQ9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col27a1Q5QNQ9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col27a1Q5QNQ9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col27a1Q5QNQ9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col27a1Q5QNQ9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col27a1Q5QNQ9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col27a1Q5QNQ9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col27a1Q5QNQ9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col27a1Q5QNQ9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col27a1Q5QNQ9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col27a1Q5QNQ9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col27a1Q5QNQ9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col27a1Q5QNQ9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col27a1Q5QNQ9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col27a1Q5QNQ9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col27a1Q5QNQ9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col27a1Q5QNQ9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col27a1Q5QNQ9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col27a1Q5QNQ9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col27a1Q5QNQ9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col27a1Q5QNQ9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col27a1Q5QNQ9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col27a1Q5QNQ9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col27a1Q5QNQ9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col27a1Q5QNQ9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col27a1Q5QNQ9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col27a1Q5QNQ9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col27a1Q5QNQ9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col27a1Q5QNQ9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col27a1Q5QNQ9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col27a1Q5QNQ9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col27a1Q5QNQ9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col27a1Q5QNQ9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col27a1Q5QNQ9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col27a1Q5QNQ9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col27a1Q5QNQ9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col27a1Q5QNQ9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col27a1Q5QNQ9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col27a1Q5QNQ9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col27a1Q5QNQ9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col27a1Q5QNQ9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col27a1Q5QNQ9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col27a1Q5QNQ9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col27a1Q5QNQ9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col27a1Q5QNQ9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col27a1Q5QNQ9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col27a1Q5QNQ9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col27a1Q5QNQ9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Col27a1Q5QNQ9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col27a1Q5QNQ9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Col27a1Q5QNQ9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col27a1Q5QNQ9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Col27a1Q5QNQ9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Col27a1Q5QNQ9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col27a1Q5QNQ9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col27a1Q5QNQ9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col27a1Q5QNQ9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col27a1Q5QNQ9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col27a1Q5QNQ9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col27a1Q5QNQ9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col27a1Q5QNQ9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col27a1Q5QNQ9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col27a1Q5QNQ9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Col27a1Q5QNQ9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col27a1Q5QNQ9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col27a1Q5QNQ9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col27a1Q5QNQ9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col27a1Q5QNQ9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col27a1Q5QNQ9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col27a1Q5QNQ9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col27a1Q5QNQ9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col27a1Q5QNQ9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col27a1Q5QNQ9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col27a1Q5QNQ9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col27a1Q5QNQ9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col27a1Q5QNQ9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col27a1Q5QNQ9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col27a1Q5QNQ9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms