Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,2■■□□□ 1,3
Clhc1Q5M6W3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Clhc1Q5M6W3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Clhc1Q5M6W3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Clhc1Q5M6W3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Clhc1Q5M6W3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Clhc1Q5M6W3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Clhc1Q5M6W3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Clhc1Q5M6W3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Clhc1Q5M6W3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Clhc1Q5M6W3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Clhc1Q5M6W3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Clhc1Q5M6W3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Clhc1Q5M6W3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23,16■■□□□ 1,3
Clhc1Q5M6W3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Clhc1Q5M6W3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Clhc1Q5M6W3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Clhc1Q5M6W3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Clhc1Q5M6W3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Clhc1Q5M6W3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Clhc1Q5M6W3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Clhc1Q5M6W3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Clhc1Q5M6W3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Clhc1Q5M6W3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Clhc1Q5M6W3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Clhc1Q5M6W3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Clhc1Q5M6W3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Clhc1Q5M6W3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Clhc1Q5M6W3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Clhc1Q5M6W3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Clhc1Q5M6W3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Clhc1Q5M6W3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23,09■■□□□ 1,29
Clhc1Q5M6W3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Clhc1Q5M6W3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23,08■■□□□ 1,29
Clhc1Q5M6W3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Clhc1Q5M6W3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Clhc1Q5M6W3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23,07■■□□□ 1,28
Clhc1Q5M6W3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Clhc1Q5M6W3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Clhc1Q5M6W3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Clhc1Q5M6W3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Clhc1Q5M6W3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Clhc1Q5M6W3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Clhc1Q5M6W3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Clhc1Q5M6W3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Clhc1Q5M6W3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Clhc1Q5M6W3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23,04■■□□□ 1,28
Clhc1Q5M6W3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,03■■□□□ 1,28
Clhc1Q5M6W3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23,03■■□□□ 1,28
Clhc1Q5M6W3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Clhc1Q5M6W3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23,02■■□□□ 1,28
Clhc1Q5M6W3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Clhc1Q5M6W3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Clhc1Q5M6W3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Clhc1Q5M6W3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Clhc1Q5M6W3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Clhc1Q5M6W3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Clhc1Q5M6W3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Clhc1Q5M6W3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Clhc1Q5M6W3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Clhc1Q5M6W3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22,98■■□□□ 1,27
Clhc1Q5M6W3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Clhc1Q5M6W3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Clhc1Q5M6W3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Clhc1Q5M6W3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Clhc1Q5M6W3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22,97■■□□□ 1,27
Clhc1Q5M6W3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Clhc1Q5M6W3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Clhc1Q5M6W3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,95■■□□□ 1,26
Clhc1Q5M6W3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Clhc1Q5M6W3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Clhc1Q5M6W3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22,93■■□□□ 1,26
Clhc1Q5M6W3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,93■■□□□ 1,26
Clhc1Q5M6W3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Clhc1Q5M6W3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Clhc1Q5M6W3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Clhc1Q5M6W3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Clhc1Q5M6W3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,92■■□□□ 1,26
Clhc1Q5M6W3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22,92■■□□□ 1,26
Clhc1Q5M6W3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Clhc1Q5M6W3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Clhc1Q5M6W3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Clhc1Q5M6W3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Clhc1Q5M6W3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Clhc1Q5M6W3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Clhc1Q5M6W3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Clhc1Q5M6W3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Clhc1Q5M6W3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Clhc1Q5M6W3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Clhc1Q5M6W3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22,89■■□□□ 1,25
Clhc1Q5M6W3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,88■■□□□ 1,25
Clhc1Q5M6W3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Clhc1Q5M6W3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Clhc1Q5M6W3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Clhc1Q5M6W3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22,87■■□□□ 1,25
Clhc1Q5M6W3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Clhc1Q5M6W3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Clhc1Q5M6W3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Clhc1Q5M6W3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22,86■■□□□ 1,25
Clhc1Q5M6W3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22,86■■□□□ 1,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,2 ms